El 11 de marzo de 2020, cuando se hizo evidente el impacto de la pandemia de COVID-19, la UIUC anunció que las clases presenciales terminarían en las vacaciones de primavera, al igual que la mayoría de las universidades. Casi de inmediato, la universidad comenzó a desarrollar una estrategia para reabrir la universidad durante el semestre de otoño, con estos elementos:
- desarrollo interno de una nueva prueba de saliva rápida, confiable y de bajo costo para el virus SARS-CoV-2, con una respuesta más rápida y un manejo más seguro que las pruebas existentes
- Adaptación de la aplicación para teléfonos inteligentes de código abierto Rokwire desarrollada por UIUC para proporcionar resultados de las pruebas de modo que las personas puedan demostrar rápidamente el permiso de entrada al edificio para las clases y otras actividades del campus.
- uso de modelos matemáticos de UIUC de propagación de enfermedades para planificar instalaciones para el aislamiento y cuarentena de los estudiantes durante y después del reingreso a mediados de agosto, y para informar decisiones cruciales sobre qué grupos deben realizar pruebas una, dos o más veces por semana.
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Formación | Marzo de 2020 |
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Organización matriz | UIUC |
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Los tres elementos se unieron, apenas a tiempo, con algunos fallos a principios del semestre, seguidos de operaciones más suaves. A fines de agosto, las pruebas de RT-qPCR realizadas en UIUC representaron el 1-2% del total de pruebas en los Estados Unidos. [1] El sistema de la Universidad de Illinois expandió rápidamente el programa a sus universidades en Springfield y Chicago . Sin embargo, la expansión a empresas y a otras escuelas y universidades, dentro y fuera de Illinois, se ralentizó debido a la necesidad de obtener la autorización en el marco del proceso EUA de la FDA . Mientras tanto, las universidades con laboratorios certificados por CLIA comenzaron a probar programas basados en la prueba de saliva UIUC mucho antes de la autorización de la FDA el 24 de febrero de 2021. Después de la autorización EUA de la FDA , las pruebas se expandieron a más de 20 universidades privadas, universidades públicas y colegios comunitarios dentro de Illinois y alrededor de 30 colegios y universidades fuera de Illinois.
Preparativos para el manejo de COVID-19
La prueba de saliva
En abril de 2020 se formó un equipo para desarrollar e implementar pruebas de COVID-19 a gran escala para su uso en el campus de UIUC. Se exploraron las posibilidades de utilizar una prueba de saliva; una prueba de este tipo puede ser un buen indicador de cuán contagiosa es una persona: analiza el líquido que probablemente sea responsable de gran parte de la transmisión entre personas. [2] El equipo, encabezado por Paul Hergenrother de la Facultad de Ciencias Químicas de la UIUC, [3] incluía personas del Instituto de Biología Genómica de la universidad , la Facultad de Medicina de Carle Illinois, el Instituto Beckman de Ciencia y Tecnología Avanzadas , el Departamento de Microbiología y la Facultad de Medicina Veterinaria, donde se reutilizó un laboratorio de diagnóstico veterinario para manejar las demandas de analizar miles de muestras por día.
Cuando este equipo comenzó su trabajo, aparecieron informes de métodos para detectar el virus en hisopos, sin el lento paso de extracción de ARN, [4] y el 10 de abril de 2020, la Universidad de Rutgers recibió la autorización de uso de emergencia de la FDA (EUA) para una prueba de saliva (que incluía extracción de ARN). [5] Dos meses después de la formación del equipo de UIUC, un artículo científico documentó la investigación del equipo sobre una prueba rápida de saliva que reemplaza la extracción de ARN por inactivación por calor, sin necesidad de que el personal de laboratorio abra el frasco después de que un individuo proporciona una muestra de saliva. [6] Mientras tanto, la Universidad de Yale desarrolló una prueba que requiere que la enzima proteinasa K se inserte en el vial antes del paso de inactivación por calor. [7]
Como laboratorio certificado por CLIA , el laboratorio de diagnóstico veterinario del campus pudo satisfacer los requisitos de prueba de la Administración de Alimentos y Medicamentos dentro de las regulaciones de LDT de la FDA . [8] A principios de julio de 2020, este laboratorio estaba ejecutando el procedimiento de saliva en muestras proporcionadas por empleados y estudiantes de UIUC. [1]
La aplicación Safer Illinois
A partir de mediados de marzo, la universidad desarrolló una aplicación de teléfono inteligente para desempeñar un papel importante en la respuesta del campus de la UIUC a la pandemia de COVID-19. [9] La "Aplicación Safer Illinois", que tuvo un lanzamiento suave el 8 de junio, [10] se construyó sobre la plataforma de teléfonos inteligentes de código abierto ROKWIRE, establecida en UIUC en 2018. Esta era una plataforma natural para usar, ya que ROKWIRE ya estaba sirviendo al campus con su primer producto, la "Aplicación de Illinois".
El 13 de agosto de 2020, días antes de la llegada de los estudiantes para el semestre de otoño, se anunció que la aplicación Safer Illinois estaba en funcionamiento. [11] Dos días después, el laboratorio de pruebas de saliva comenzó a analizar un número creciente de muestras 7 días a la semana. [12]
Modelado
Se utilizó un modelo matemático para estimar la cantidad de personas que darían positivo en la prueba de detección de ingreso durante el 15 al 23 de agosto. [13] Una estimación, realizada el 24 de julio utilizando un modelo UIUC existente de la dinámica de COVID-19 en Illinois, [14] proyectada hasta mediados de agosto para estimar el porcentaje de personas infectadas dentro del estado de Illinois a mediados de agosto: 0,44%. En base a esto, se anticipó la detección de aproximadamente 200 infecciones positivas durante el cribado de entrada, con un intervalo de confianza del 95% de 72 a 414 infecciones. Para los estudiantes en viviendas universitarias, alrededor del 5% del inventario de habitaciones del campus se reservó para aislamiento o cuarentena. [15]
El año académico 2020-2021
El regreso al campus y un pico temprano
Se realizaron 55,034 pruebas durante el regreso al campus del 15 al 23 de agosto, y 288 personas dieron positivo. [12] Este número se encuentra dentro del intervalo de confianza del 95% del modelo de "cribado de entrada" de 72 a 414 positivos. Esta positividad del 0.5% continuó durante la primera semana de clases, del 24 al 28 de agosto. Los siguientes cuatro días, del 29 de agosto al 1 de septiembre, vieron 588 pruebas positivas, casi igualando el número de positivas durante los 14 días anteriores. Se consideró que esto reflejaba un comportamiento de riesgo, especialmente entre los estudiantes universitarios. [16] [17] El 2 de septiembre, un correo masivo del campus anunció un período de "solo actividades esenciales" de dos semanas en toda la universidad y anunció mayores esfuerzos para identificar y eliminar a las personas que estaban creando riesgos para el campus y la comunidad. [18]
En este momento, el escritor del New York Times, Kenneth Chang, reconoció la respuesta general de UIUC COVID-19 como "uno de los planes más completos de una importante universidad para mantener el virus bajo control" y contrastó el enfoque de UIUC con el de la mayoría de las otras grandes universidades estatales. "abriendo y esperando lo mejor sin hacer ningún tipo de pruebas serias o se han cambiado a la educación en gran parte en línea", citando al biólogo Carl Bergstrom . [19] Durante la segunda semana de "actividades esenciales" hubo una disminución considerable en el número de casos observados y, el 16 de septiembre, un correo masivo del campus [20] terminó el período de dos semanas.
Gestión permanente del campus COVID-19
Inicialmente, el plan de la UIUC era evaluar a cada individuo una vez por semana. Sin embargo, según los estudios de modelos, esto se cambió a dos veces por semana antes de que un gran número de estudiantes llegara al campus en agosto. Esta tasa fue caracterizada por Nick Anderson del Washington Post como "un ritmo asombroso para una gran escuela pública". [21]
Pronto, esta tasa de pruebas tensó la capacidad del laboratorio para producir resultados rápidos, lo que debilitó la capacidad del programa de pruebas para identificar rápidamente a las personas que deberían entrar en cuarentena. [22] Al mismo tiempo, quedó claro que menos del 5% de las pruebas positivas procedían de profesores, personal y estudiantes de posgrado. Entonces, el 7 de septiembre de 2020, las pruebas de estos grupos se redujeron a una vez por semana. [20] Esto, combinado con una expansión de la capacidad del laboratorio, provocó que los tiempos de respuesta del laboratorio se redujeran de 48 horas a principios del semestre a un poco más de 8 horas a principios de octubre. [23]
El número de pruebas positivas alcanzó un mínimo de un semestre de 85 nuevas detecciones de COVID-19 durante la semana del 10 al 16 de octubre, y luego aumentó de manera constante durante las siguientes tres semanas. [24] El 10 de noviembre, la universidad anunció que la positividad de los profesores, el personal y los estudiantes graduados estaba aumentando rápidamente, por lo que se requirió que estos grupos reanudaran las pruebas dos veces por semana.
Referencias
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enlaces externos
- Correos masivos UIUC COVID-19
- Datos de prueba de UIUC Shield