Melbourne Bioinformática
Melbourne Bioinformatics (anteriormente la Iniciativa de Computación de Ciencias de la Vida de Victoria, VLSCI) es un centro de experiencia en ciencias de la vida computacional. Proporciona apoyo bioinformático a todos los investigadores y estudiantes en una amplia gama de proyectos y servicios de importancia local y nacional. Los investigadores pueden interactuar con Melbourne Bioinformatics a través de la formación y la consulta con expertos que pueden conducir a colaboraciones de proyectos con el personal académico de la Universidad de Melbourne.
El VLSCI se estableció como parte de los planes del gobierno de Victoria para apoyar la biotecnología y fue incluido como un proyecto de infraestructura clave en el Plan de Acción de Biotecnología de Victoria de 2011. [1] Fue una iniciativa de $ 100 millones del Gobierno de Victoria en asociación con la Universidad de Melbourne y el IBM Life Sciences Research Collaboratory, Melbourne. [2] Otras partes interesadas importantes fueron las principales instituciones de investigación médica y de salud de Victoria, las principales universidades y las organizaciones públicas de investigación. [1]
En 2015, el VLSCI pasó a un nuevo modelo de gobernanza después de recibir otros $ 6,65 millones del gobierno del estado de Victoria. El primer IBM Research Collaboratory for Life Sciences estuvo ubicado en VLSCI durante 5 años. Desde que se mudó a las oficinas cercanas de IBM Research Australia, el personal de Collaboratory ha continuado trabajando en una variedad de proyectos como parte de una asociación más amplia entre la Universidad de Melbourne e IBM bajo el nuevo nombre de Melbourne Bioinformatics. [3] [4]
La instalación de computación de alto rendimiento a petaescala de Melbourne Bioinformatics era accesible para los investigadores en Victoria operando en varias universidades e institutos de investigación en Melbourne. Los grupos se encontraban entre los 500 primeros a nivel mundial en 2017. [5] Los expertos técnicos formaron parte del personal para maximizar la experiencia del usuario, cubrir las brechas de habilidades en los equipos de investigación, construir las colaboraciones de investigación interdisciplinarias necesarias y proporcionar habilidades para ampliar los proyectos a utilizar de manera eficiente la potencia de procesamiento que se entrega. Se brindó capacitación y desarrollo de habilidades continuos en biología computacional , modelado molecular y bioinformática.
En su apogeo, Peak Computing Facility de VLSCI operó a 855 teraflops. Los sistemas incluyen 'Barcoo', un IBM iDataPlex x86, 'Merri', un IBM iDataPlex x86 y 'Avoca', que comprende 4 bastidores de IBM Blue Gene / Q .
VLSCI Peak Computing Facility (PCF) proporcionó infraestructura informática de alto rendimiento y experiencia informática a los investigadores de ciencias biológicas de Victoria. El PCF tenía clústeres estrechamente acoplados con subsistemas de disco muy rápidos, que actualmente operan a una capacidad máxima de 855 teraflops. Para ayudar a los investigadores a maximizar el uso del tiempo de cómputo y aprovechar al máximo sus recursos asignados, el PCF tenía un equipo de administradores de sistemas, programadores y especialistas en aplicaciones accesibles a través de su sistema de solicitud de ayuda.
