La Copa de la Liga Sur de 1945-1946 fue la sexta y última edición del torneo regional de fútbol en tiempo de guerra . La Liga del Noreste y la Copa de la Liga del Noreste habían terminado la temporada anterior , los equipos de esas competiciones se unieron a la Liga del Sur y la Copa de la Liga del Sur. Con la Liga del Sur actuando ahora de manera efectiva como una liga nacional, la competencia se dividió en dos Divisiones. Por lo tanto, la Copa de la Liga también se dividió en dos divisiones.
Aberdeen ganó el torneo, derrotando a los Rangers por 3-2 en la final en Hampden Park ante una multitud de 135.000 espectadores. Esta fue la última edición de la competencia, pero el trofeo en sí se usó nuevamente para la Copa de la Victoria de 1946 que se jugó solo unas semanas después (ganada por los Rangers), por lo que Aberdeen solo poseyó la copa por un corto tiempo. Los mismos equipos se enfrentaron en la primera oficial de la Liga escocesa Copa final, el año siguiente . [1]