Las proteínas AAA o TPasas A asociadas con diversas actividades celulares son una familia de proteínas que comparten un módulo conservado común de aproximadamente 230 residuos de aminoácidos. Se trata de una familia de proteínas grande y funcionalmente diversa que pertenece a la superfamilia de proteínas AAA + de NTPasas de bucle P en forma de anillo , que ejercen su actividad a través de la remodelación o translocación de macromoléculas dependiente de la energía. [2] [3]
Las proteínas AAA acoplan la energía química proporcionada por la hidrólisis de ATP a cambios conformacionales que se transducen en fuerza mecánica ejercida sobre un sustrato macromolecular . [4]
Las proteínas AAA son funcional y organizativamente diversas y varían en actividad, estabilidad y mecanismo. [4] Los miembros de la familia AAA se encuentran en todos los organismos [5] y son esenciales para muchas funciones celulares. Están involucrados en procesos como la replicación del ADN, la degradación de proteínas, la fusión de membranas, la separación de microtúbulos, la biogénesis de peroxisomas, la transducción de señales y la regulación de la expresión génica.
El dominio AAA contiene dos subdominios, un dominio alfa / beta N-terminal que se une e hidroliza nucleótidos (un pliegue de Rossmann ) y un dominio de hélice alfa C-terminal. [5] El dominio N-terminal tiene una longitud de 200-250 aminoácidos y contiene motivos Walker A y Walker B , [5] y se comparte en común con otras NTPasas de bucle P, la superfamilia que incluye la familia AAA. [6] La mayoría de las proteínas AAA tienen dominios adicionales que se utilizan para la oligomerización, unión de sustrato y / o regulación. Estos dominios pueden estar en el terminal N o C del módulo AAA.
Algunas clases de proteínas AAA tienen un dominio no ATPasa N-terminal que va seguido de uno o dos dominios AAA (D1 y D2). En algunas proteínas con dos dominios AAA, ambos están bien conservados evolutivamente (como en Cdc48 / p97). En otros, el dominio D2 (como en Pex1p y Pex6p) o el dominio D1 (en Sec18p / NSF) se conserva mejor en la evolución.
Si bien la familia AAA clásica se basó en motivos, la familia se ha ampliado utilizando información estructural y ahora se denomina familia AAA. [5]