Agarase ( EC 3.2.1.81 , AgaA , AgaB , endo-beta-agarase , agarosa 3-glycanohydrolasse ) es una enzima con nombre sistemático agarosa 4-glycanohydrolase . Se encuentra en bacterias agarolíticas y es la primera enzima en la vía catabólica del agar . [1] Es responsable de permitirles usar agar como su principal fuente de carbono y les permite prosperar en el océano.
Las agarasas se clasifican como α-agarasas o β-agarasas en función de si degradan los enlaces α o β en la agarosa, rompiéndolos en oligosacáridos. Cuando se secretan, las α-agarasas producen oligosacáridos con 3,6 anhidro-L-galactosa en el extremo reductor, mientras que las β-agarasas dan como resultado residuos de D-galactosa. [2]
Como era de esperar, muchas especies de degradadores de agar son microorganismos marinos, una adaptación a su medio ambiente que se desperdiciaría en la mayoría de los microorganismos existentes en la tierra (aunque existen tales ejemplos, incluida una especie de Paenibacillus en el Rizosfera de espinacas [3] ). Desde especies dentro del género Vibrio [4] hasta Alteromonas , [5] la presencia de agarasa permite que las bacterias que degradan el agar sean una fuente de alimento abundante en el océano. La investigación también demuestra que la glucosa puede inhibir la secreción de agarasa extracelular (pero no la transcripción), lo que hace que se degrade dentro de la célula y, por lo tanto, limite el crecimiento de las bacterias. [5]Además, un estudio de los efectos de la limitación de fosfato sobre la agarasa muestra que la limitación de fosfato aumenta tanto la producción de agarasa intracelular como la secreción extracelular, mientras que la limitación de magnesio no lo hace. [6] Esto resalta aún más el nicho que suele ocupar esta clase de bacterias, ya que la concentración de glucosa o fosfato en el océano es muy baja mientras que la concentración de magnesio es generalmente mucho más alta, lo que se adapta a la producción de agarasa de las bacterias que degradan el agar; simplemente no hay necesidad de usar glucosa en el océano, por lo que muchos organismos no lo hacen.