La familia de programas BLUPF90 es un paquete de software estadístico utilizado en genética cuantitativa para la cría de animales y plantas . [1] [2] Puede ajustarse a modelos mixtos utilizando la máxima verosimilitud restringida , así como el muestreo de Gibbs para estimar los componentes de la varianza y predecir los valores de reproducción mediante la mejor predicción lineal insesgada (BLUP).
Codificado en Fortran , puede realizar una selección genómica en cientos de miles de individuos genotipados . [3]
Las versiones compiladas de BLUPF90 están disponibles gratuitamente para investigación y pueden usarse en Linux, Microsoft Windows y Mac OS X. [4] [5] También existe un complemento para R (lenguaje de programación) . [6]
Referencias
- ^ Misztal, Ignacy (1999). "Modelos complejos, más datos: ¿programación más sencilla?". Boletín Interbull . 20 : 33–42.
- ^ Misztal, yo; Tsuruta, S; Strabel, T; Auvray, B; Druet, T; Lee, DH (2002). BLUPF90 y programas relacionados (BGF90) . VII Congreso Mundial de Genética Aplicada a la Producción Ganadera. Montpellier, Francia.
- ^ Aguilar, yo; Misztal, yo; Tsuruta, S; Legarra, A; Wang, H (2014). PREGSF90 - POSTGSF90: Herramientas computacionales para la implementación de la selección genómica de un solo paso y la asociación de todo el genoma con individuos no genotipados en programas BLUPF90 (PDF) . X Congreso Mundial de Genética Aplicada a la Producción Ganadera. Sociedad Estadounidense de Ciencia Animal, Champaign, IL.
- ^ http://nce.ads.uga.edu/software/
- ^ http://nce.ads.uga.edu/wiki/doku.php?id=start
- ^ https://famuvie.github.io/breedR/