biblioma


El biblioma es la totalidad del corpus textual biológico . Este término fue acuñado alrededor del año 2000 en EBI ( Instituto Europeo de Bioinformática ) para denotar la importancia de la información del texto biológico. Términos similares que se han utilizado con menos frecuencia son literaturoma y textoma . [ cita requerida ] Por analogía aproximada con términos ampliamente utilizados como genoma, metaboloma, proteoma y transcriptoma, este -oma se referiría correctamente a la literatura de un campo específico o contextualmente implícito, por lo tanto: biblioma biológico , biblioma político , etc. [ cita necesario ]Sin embargo, el término no se ha aplicado (todavía) fuera de las ciencias biológicas y médicas, por lo que actualmente se aplica por defecto solo a los campos biomédicos. Tendría poco sentido aplicarlo a un cuerpo particular de textos como MEDLINE, a pesar de una analogía natural que podría parecer sugerir esto: los términos genoma , proteoma , canaloma , metaboloma y transcriptoma generalmente asumen un organismo específico o un conjunto de células. y (excepto para el genoma) un punto de tiempo específico. La razón por la que seguir esta analogía tendría poco sentido es que ya existe un término establecido para este fin, corpus .

Desde el biblioma, biólogos e informáticos extraen datos para descubrir nuevas dianas genéticas y fármacos . La bibliomática es el estudio bioinformático del biblioma. Bibliome no es un pseudooma porque es un concepto útil que utilizan los bioinformáticos.

EAGLi es un motor de recuperación biomédica para MEDLINE. GOCat es un categorizador/navegador GO automático para ayudar a la anotación funcional de textos biomédicos; también es útil para caracterizar funcionalmente las listas de nombres de proteínas y genes generadas por experimentos de alto rendimiento.