Biskit es un paquete de software de código abierto escrito en Python . El paquete facilita la investigación en bioinformática estructural y modelado molecular . Biskit se divide en dos partes:
- una biblioteca de programación orientada a objetos para manipular y analizar estructuras macromoleculares, complejos de proteínas y trayectorias de dinámica molecular
- sobre la base de la biblioteca, un conjunto de programas para resolver tareas específicas, por ejemplo, la predicción automática de estructuras de proteínas mediante el modelado de homología o (un intento de) la predicción de estructuras de complejos de proteínas a través del acoplamiento flexible proteína-proteína
Desarrollador (es) | Raik Grünberg, Johan Leckner y otros |
---|---|
Lanzamiento estable | 2.5.1 [1] / 24 de septiembre de 2018 |
Repositorio | |
Escrito en | Pitón |
Sistema operativo | UNIX , Linux , Mac OS X |
Tipo | Herramienta de bioinformática |
Licencia | GPL |
Sitio web | biskit |
La biblioteca Biskit delega muchos cálculos a programas de terceros más especializados y actualmente incluye alrededor de 15 aplicaciones externas. Algunos ejemplos son X-PLOR , Hex , T-Coffee , DSSP y MODELLER .
La última versión 2.4.0 se lanzó el 4 de marzo de 2012 y el proyecto se encuentra en desarrollo activo. Biskit se desarrolló originalmente en el Instituto Pasteur y el nombre Biskit hace referencia al título del grupo de investigación: "Unité de B io I nformatique S tructurale".
enlaces externos
- ^ "Versión 2.5.1" . 24 de septiembre de 2018 . Consultado el 24 de septiembre de 2018 .