Los Comentarios de Coimbra, también conocidos como Conimbricenses, son un grupo de 11 libros sobre Aristóteles (solo ocho pueden llamarse comentarios). Los nombres de 200 jesuitas, incluidos los de profesores y estudiantes, aparecieron repetidamente en los registros universitarios. Desde finales del siglo XVI hasta principios del XVII, la universidad produjo voluminosos comentarios sobre los escritos filosóficos de Aristóteles. Los comentarios fueron, de hecho, dictados a los estudiantes por los profesores y, por lo tanto, no estaban destinados a su publicación. Después de que se publicaron de todos modos, para interpretar y desconocer ediciones incorrectas y no autorizadas, Claudio Acquaviva , el General de la Compañía de Jesús, asignó a Pedro da Fonseca, al provincial de la provincia portuguesa, la tarea de supervisar la revisión de los comentarios para su publicación autorizada. Fonseca fue llamado "el Aristóteles de Portugal" por Charles George Herbermann en su Enciclopedia Católica .
Un prólogo prefijó el último tratado y repudió cualquier conexión con el trabajo publicado en Frankfurt en 1604 y que afirmaba ser el "Commentarii Conimbricenses". Dice en parte: "Antes de que pudiéramos terminar la tarea que se nos encomendó de editar nuestra Lógica, a la que estábamos obligados por muchas promesas, ciertos editores alemanes sacaron fraudulentamente una obra que pretendía ser nuestra, abundante en errores e inexactitudes que eran realmente suyos. También sustituyeron a nuestros comentarios por ciertas glosas conseguidas furtivamente. Es cierto que estos escritos treinta años antes eran obra de uno de nuestros profesores que no estaba destinado a ser publicado. Eran fruto de su celo y nunca soñó que lo serían. aparecen impresos".
El último tratado fue preparado para la imprenta por el padre Sebastián Couto. Las ocho partes formaron cinco volúmenes en cuarto de amplia circulación y aparecieron en muchas ediciones. Los más conocidos fueron los de Lyon , Lisboa y Colonia . Los Comentarios están en latín y se complementan con explicaciones confiables del texto y una discusión exhaustiva del sistema aristotélico.