La purificación de ácidos nucleicos basada en columna giratoria es un método de extracción en fase sólida para purificar rápidamente los ácidos nucleicos . Este método se basa en el hecho de que el ácido nucleico se unirá a la fase sólida de sílice bajo ciertas condiciones.
Las etapas del método son lisar, unir, lavar y eluir. [1] [2] Más específicamente, esto implica la lisis de las células objetivo para liberar ácidos nucleicos , la unión selectiva del ácido nucleico a una membrana de sílice, el lavado de partículas e inhibidores que no están unidos a la membrana de sílice y la elución del ácido nucleico . ácido, siendo el resultado final ácido nucleico purificado en solución acuosa.
Para la lisis, las células (sangre, tejido, etc.) de la muestra deben someterse a un tratamiento para romper la membrana celular y liberar el ácido nucleico. Dependiendo del material de destino, esto puede incluir el uso de detergente u otros tampones, proteinasas u otras enzimas, calentamiento a varios tiempos/temperaturas, o disrupción mecánica, como cortar con un cuchillo u homogeneizador , usar un mortero y mano, o perla. batiendo con un molino de bolas.
Para la unión, se añade una solución tampón a la muestra lisada junto con etanol o isopropanol . Luego, la muestra en la solución de unión se transfiere a una columna giratoria y la columna se coloca en una centrífuga o se conecta al vacío. La centrífuga/vacío fuerza la solución a través de una membrana de sílice que se encuentra dentro de la columna de centrifugación, donde, en las condiciones iónicas adecuadas, los ácidos nucleicos se unirán a la membrana de sílice, a medida que pasa el resto de la solución. Con el material de destino unido, se puede eliminar el flujo continuo.
Para lavar, se agrega un nuevo tampón a la columna, luego se centrifuga/aspira a través de la membrana. Este tampón está destinado a mantener las condiciones de unión, mientras elimina las sales de unión y otros contaminantes restantes. Generalmente se necesitan varios lavados, a menudo con porcentajes crecientes de etanol/isopropanol, hasta que el ácido nucleico de la membrana de sílice esté libre de contaminantes. El último 'lavado' es a menudo un paso seco para permitir que el alcohol se evapore, dejando solo ácidos nucleicos purificados unidos a la columna.
Finalmente, la elución es el proceso de agregar una solución acuosa a la columna, lo que permite que el ácido nucleico hidrófilo abandone la columna y vuelva a la solución. Este paso se puede mejorar con sal, pH, tiempo o calor. Finalmente, para capturar el eluato/eluyente, la columna se transfiere a un microtubo limpio antes de un último paso de centrifugado.