La Evaluación Crítica de la Predicción de Interacciones (CAPRI) es un experimento de toda la comunidad para modelar la estructura molecular de complejos de proteínas , también conocido como acoplamiento proteína-proteína .
El CAPRI [1] es una serie de eventos en curso en los que los investigadores de toda la comunidad intentan acoplar las mismas proteínas, según lo proporcionado por los evaluadores. Las rondas se realizan aproximadamente cada seis meses. Cada ronda contiene entre uno y seis complejos proteína-proteína diana cuyas estructuras se han determinado recientemente de forma experimental. Las coordenadas y son mantenidas en forma privada por los evaluadores, con la cooperación de los biólogos estructurales que las determinaron. El experimento CAPRI es doble ciego , en el sentido de que los remitentes no conocen la estructura resuelta y los evaluadores desconocen la correspondencia entre un envío y la identidad de su creador.
Ver también
- Evaluación crítica de técnicas para la predicción de la estructura de proteínas (CASP): un ejercicio similar en el campo de la predicción de la estructura de proteínas
- Evaluación crítica de la anotación funcional (CAFA)
Referencias
- ^ Joël Janin; Kim Henrick; John Moult; Lynn Ten Eyck; Michael JE Sternberg; Sandor Vajda; Ilya Vakser; Shoshana Wodak (1 de julio de 2003). "CAPRI: una evaluación crítica de las interacciones previstas". Las proteínas . 52 (1): 2–9. CiteSeerX 10.1.1.461.3355 . doi : 10.1002 / PROT.10381 . ISSN 1097-0134 . PMID 12784359 . S2CID 31489448 . Wikidata Q28208450 .
enlaces externos
Lista de servidores de predicciones que participan en CAPRI
- ClusPro
- GRAMM-X
- FireDock
- HADDOCK - DOCKing proteína-proteína impulsado por alta ambigüedad
- pyDockWEB : predicción estructural de interacciones proteína-proteína
- PatchDock
- SmoothDock
- 3D-Garden - Nexo de exploración de atraque global y restringido
- SwarmDock
- MUELLE / PIE