El ciclismo en los Juegos Paralímpicos de Verano de 2004 en Atenas consistió en 31 eventos en dos disciplinas, ciclismo en pista y ciclismo en ruta . El ciclismo de pista tuvo lugar en el Velódromo Olímpico y el ciclismo de ruta en Vouliagmeni .
Los eventos en ruta consistieron en carreras de resistencia y contrarreloj. En las carreras de resistencia en ruta, los atletas con parálisis cerebral pedalearon un mínimo de 15 kilómetros, mientras que los hombres con discapacidad visual recorrieron 120 kilómetros. En las contrarreloj, las distancias fueron las mismas para cada clasificación.