Debora S. Marks es investigadora en biología computacional y profesora asociada de biología de sistemas en la Escuela de Medicina de Harvard . [1] Su investigación utiliza enfoques computacionales para abordar una variedad de problemas biológicos.
Marcas Debora | |
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alma mater | Universidad de Bristol , Universidad de Manchester , Universidad Humboldt |
Premios | Premio Overton , Premio Ben Barres Early Career Award |
Carrera científica | |
Campos | Biología Estructural , Bioinformática |
Instituciones | Escuela Médica de Harvard |
Tesis | (2010) |
Asesor de doctorado | Reinhard Heinrich , Hanspeter Herzl |
Sitio web | https://marks.hms.harvard.edu/ |
Carrera e investigación
Después de una licenciatura en medicina, trabajó en la industria farmacéutica y volvió a la investigación a una edad avanzada a través de un título en matemáticas de la Universidad de Manchester . [2] Se interesó en los microARN a principios de la década de 2000 [2] [3] [4] y su trabajo sobre la biología de los microARN finalmente se convirtió en una tesis de doctorado, que presentó bajo la dirección de Reinhart Heinrich a la Universidad Humboldt de Berlín en 2010. [5] Una contribución clave fue su descubrimiento de que la transfección de microARN en células aumenta de manera contraintuitiva la expresión de algunos genes, debido a la competencia por la maquinaria celular que procesa los ARN pequeños. [6] En colaboración con Alexander van Oudenaarden y Nils Bluthgen, mostró que los microARN reducen el ruido en la expresión de proteínas cuando los niveles de ARNm son bajos, lo que reduce la probabilidad de expresión de proteínas no deseada como resultado de una fuga en el promotor de un gen. [7]
Es mejor conocida por su trabajo en la predicción de la estructura de las proteínas: su método, que se basa en un enfoque de la física estadística, la máxima entropía bajo restricción, utiliza correlaciones entre las secuencias de miembros de la familia de proteínas de múltiples especies para construir modelos de estructura de proteínas a partir de una sola secuencia. . [8] En algunos casos, los modelos predichos son lo suficientemente precisos como para permitir el reemplazo molecular del modelo en datos de cristalografía de rayos X , lo que facilita el reemplazo de fase. [9] El algoritmo [10] ha sido ampliamente utilizado por otros investigadores para predecir y obtener conocimientos sobre las estructuras de las proteínas, por ejemplo, las estructuras del receptor σ2 [11] y la tetraspanina CD81 . [12] Marks y su colaborador cercano Chris Sander han demostrado que este enfoque también se puede utilizar para predecir las estructuras de ARN no codificantes y complejos ARN-proteína, [13] para identificar estados estructurados que de otro modo serían indetectables en proteínas desordenadas [14] y para predecir los efectos funcionales de las mutaciones de secuencia. [15]
Premios
En 2016, Marks recibió el Premio Overton de la Sociedad Internacional de Biología Computacional . [dieciséis]
En 2018, Marks recibió el premio Ben Barres Early Career Award otorgado por la Iniciativa Chan Zuckerberg como parte de la Neurodegeneration Challenge Network. [17]
Referencias
- ^ "Laboratorio de Debora S. Marks" . Consultado el 11 de julio de 2016 .
- ^ a b "Premio Overton 2016: Debora Marks" . www.iscb.org . Consultado el 1 de enero de 2019 .
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- ^ John B, Enright AJ, Aravin A, Tuschl T, Sander C, Marks DS (noviembre de 2004). "Dianas de microARN humanos" . PLoS Biology . 2 (11): e363. doi : 10.1371 / journal.pbio.0020363 . PMC 521178 . PMID 15502875 .
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- ^ Hopf TA, Ingraham JB, Poelwijk FJ, Schärfe CP, Springer M, Sander C, Marks DS (febrero de 2017). "Efectos de mutación predichos de co-variación de secuencia" . Biotecnología de la naturaleza . 35 (2): 128-135. doi : 10.1038 / nbt.3769 . PMC 5383098 . PMID 28092658 .
- ^ "17 de febrero de 2016: ISCB felicita a los ganadores del premio 2016, Soren Brunak, Debora Marks, Burkhard Rost y Serafim Batzoglou" . www.iscb.org . Consultado el 11 de julio de 2016 .
- ^ "Iniciativa científica de Chan Zuckerberg" . Red de Desafío de Neurodegeneración . Consultado el 1 de enero de 2019 .
enlaces externos
- Publicaciones de Debora Marks indexadas por Google Scholar
- Sitio oficial del laboratorio D.Marks