La Sociedad Internacional de Biología Computacional ( ISCB ) es una sociedad académica para investigadores en biología computacional y bioinformática . La sociedad fue fundada en 1997 para proporcionar un hogar financiero estable para la conferencia de Sistemas Inteligentes para Biología Molecular (ISMB) y ha crecido hasta convertirse en una sociedad más grande que trabaja para avanzar en la comprensión de los sistemas vivos a través de la computación y para comunicar los avances científicos en todo el mundo.
Abreviatura | ISCB |
---|---|
Formación | 1997 |
Tipo | Sociedad culta |
Sede | Leesburg, VA , Estados Unidos [1] |
Membresía (2016) | ~ 3400 [2] |
presidente | Thomas Lengauer |
Gente clave |
|
Subsidiarias | Consejo de estudiantes de ISCB |
Sitio web | iscb |
Además de ISMB, la sociedad también organiza un número creciente de conferencias más pequeñas, más centradas en temas regionales o temáticos y presenta una serie de premios anuales por logros científicos, incluidos el Premio Overton y los Premios ISCB Senior Scientist . [3] [4] [5]
Descripción general
La membresía de la sociedad refleja el compromiso con el avance de la biología computacional. La ISCB es una organización internacional sin fines de lucro cuyos miembros provienen de las comunidades globales de bioinformática y biología computacional. La ISCB sirve a sus miembros globales proporcionando reuniones, publicaciones e informes de alta calidad sobre métodos y herramientas; difundiendo información clave sobre recursos bioinformáticos y noticias relevantes de campos relacionados; y facilitando activamente la formación, la educación, el empleo, el desarrollo profesional y la creación de redes. La sociedad también defiende y proporciona liderazgo para los recursos y las políticas en apoyo de los esfuerzos científicos y en beneficio de la sociedad en general.
ISCB busca comunicar la importancia de la biología computacional a la comunidad científica en general, a las organizaciones gubernamentales y al público en general; la sociedad sirve a sus miembros a nivel local, nacional e internacional; proporciona orientación para políticas científicas, publicaciones, reuniones y distribuye información a través de múltiples plataformas. ISCB organiza la conferencia Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) cada año, un número creciente de conferencias anuales y bianuales más pequeñas, más regionales o temáticas, y tiene tres revistas oficiales: ISCB Community Journal, PLOS Computational Biology y Bioinformatics . Los premios de la sociedad tres premios por logros científicos al año: el Premio Overton , el Premio a la Innovación ISCB , [6] y los Premios ISCB científico superior . La sociedad elige a los becarios ISCB anualmente, para honrar a los miembros que se han distinguido por sus contribuciones destacadas a los campos de la biología computacional y la bioinformática. La ISCB también otorga el Premio a las Contribuciones Sobresalientes de la ISCB para reconocer a los miembros de la comunidad que han contribuido significativamente al éxito de la organización.
Historia
Establecimiento
La serie de conferencias Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) comenzó en 1993. [7] Como respuesta a la expansión de la conferencia, la ISCB se fundó en 1997 y una parte importante de su cometido es proporcionar un hogar financiero estable para ISMB. . [8] [9] La ISCB se incorporó legalmente a principios de 1997, [9] con Lawrence Hunter elegido como su presidente inaugural por los miembros de la junta directiva fundadora, que incluía a Russ Altman , Philip Bourne , David States y Alfonso Valencia . [10] La ISCB ha organizado la conferencia ISMB desde 1998. [11]
Durante los años siguientes, la atención se mantuvo en la gestión de la conferencia anual ISMB, cuya asistencia en 1993 de aproximadamente 200 investigadores se había más que triplicado en 1999.
El nuevo milenio trajo un nuevo presidente en Russ Altman , actualmente [ ¿cuándo? ] presidente del departamento de bioingeniería de la Universidad de Stanford y director del programa de informática biomédica, y más de 1.200 delegados asistieron a ISMB 2000 en San Diego . Altman tomó medidas para formalizar algunos de los aspectos legales y administrativos de ISCB antes de pasar la antorcha en 2002 a Philip E. Bourne , actualmente [ ¿cuándo? ] profesor del departamento de farmacología y de la Facultad de Farmacia y Ciencias Farmacéuticas Skaggs de la Universidad de California , San Diego . Bourne le dio a ISCB un hogar más permanente en UCSD, que incluyó el compromiso de la universidad de albergar a la sociedad al menos hasta 2005 y su oferta de apoyo al personal. Aunque Bourne se desempeñó como presidente durante solo un año, dejó su huella en la sociedad al aumentar la interacción con los grupos regionales y los organizadores de conferencias en todo el mundo, y mediante una mejor presencia en la web. Durante su mandato, la membresía aumentó a más de 1,700 investigadores, y la conferencia ISMB 2002 en Edmonton, Alberta, Canadá dio la bienvenida a más de 1,600 asistentes.
Expansión
Michael Gribskov , entonces en el departamento de supercomputación de San Diego de UCSD y ahora en el departamento de ciencias biológicas de la Universidad Purdue , fue elegido presidente en 2003. Ese año, ISMB se llevó a cabo en Brisbane , Australia, que fue la primera vez que la reunión se realizó fuera de América del Norte. o Europa. Esta fase trajo muchas incertidumbres para la sociedad cuando la asistencia se redujo a la mitad de las expectativas presupuestadas debido a los temores de viajar y las restricciones relacionadas con los brotes del Síndrome Respiratorio Agudo Severo o SARS , el inicio de la guerra en Irak y la ubicación, que rompió con el patrón de los lugares de América del Norte y Europa. Aunque científicamente exitoso, las pérdidas financieras de ISMB 2003 dejaron a ISCB financieramente inestable por primera vez en su historia.
En parte para reducir la dependencia de ISCB de los ingresos de ISMB para financiar las actividades de la sociedad y los costos generales anuales, se organizó una conferencia regional piloto en los Estados Unidos para medir el interés en reuniones más pequeñas y localizadas. En diciembre de 2003, se inauguró en Aspen , Colorado, la conferencia sobre bioinformática regional de las Montañas Rocosas, Rocky 1 . La reunión se ha celebrado anualmente desde entonces y ahora atrae a asistentes de todo el mundo.
En 2005, como parte de las discusiones de la sociedad sobre el papel de las publicaciones y el diario oficial de la sociedad, acompañado por el advenimiento de la publicación de acceso abierto, la ISCB anunció una asociación con la Biblioteca Pública de Ciencias y lanzó una nueva revista de acceso abierto , PLoS Computational Biología . La revista tiene como objetivo enfatizar los métodos computacionales aplicados a los sistemas vivos en todas las escalas, desde la biología molecular hasta las poblaciones de pacientes y los ecosistemas, y que ofrecen información para los experimentadores. El ex presidente y ex presidente del comité de publicaciones, Phil Bourne, se desempeñó como editor en jefe de la nueva publicación y permanece en ese cargo. El primer número de la nueva revista coincidió con la jornada inaugural de ISMB 2005, celebrada en Detroit , Michigan .
Burkhard Rost , entonces profesor en el departamento de bioquímica y biofísica molecular de la Universidad de Columbia y ahora profesor Alexander von Humboldt y presidente de bioinformática y biología computacional, ciencias computacionales en la Universidad Técnica de Múnich , sucedió a Michael Gribskov como presidente en 2007 y ha sido reelegido. dos veces con un vencimiento del mandato actual fijado para enero de 2013. Bajo su mandato, la conferencia ISMB / ECCB 2007 en Viena, Austria, presidida por Thomas Lengauer del Instituto Max-Planck de Informática, y copresidida por Burkhard Rost y Peter Schuster del Universidad de Viena , se amplió aún más para incluir un total de ocho pistas paralelas, y la asistencia a la conferencia de 2007 de aproximadamente 1.700 personas volvió a la normalidad con las expectativas. Viena como destino y el Austria Center Vienna fueron tan bien recibidos por los organizadores de la conferencia como por los asistentes por igual que fueron seleccionados para albergar la conferencia de 2011, que es la primera de la serie ISMB que nunca antes había repetido un lugar.
En 2010 se llevó a cabo el primer ISCB Latin America en Montevideo , Uruguay.
Liderazgo y estructura
Un presidente, un comité ejecutivo y una junta directiva componen el liderazgo científico de ISCB, que se basa en investigadores distinguidos de renombre internacional que son elegidos para su mandato por los miembros de la sociedad en general. El director ejecutivo dirige al personal de ISCB y apoya a un conjunto diverso de comités dedicados a temas específicos que son importantes para la comunidad de biología computacional y bioinformática, incluida la educación, las políticas y las publicaciones.
Presidentes
Lawrence Hunter
(1997-2000)Russ Altman
(2000-2002)Philip Bourne
(2002-2003)Michael Gribskov (izquierda)
(2003-2007)Burkhard Rost
(2007-2014)Alfonso Valencia
(2015-2018)Thomas Lengauer
(2018-2020)Christine Orengo
(2020-presente)
Junta Directiva
A partir de 2018[actualizar]Entre los miembros notables de la junta directiva se incluyen: Alex Bateman , Bonnie Berger , Terry Gaasterland , Janet Kelso , Thomas Lengauer , Yves Moreau , Christine Orengo , Burkhard Rost , Alfonso Valencia y Martin Vingron . [12]
Becarios
La ISCB ha elegido Fellows desde 2009. Estas distinciones se otorgan en honor a contribuciones destacadas a los campos de la biología computacional y la bioinformática. [13] La clase inaugural se le dio a los ganadores anteriores del logro ISCB por un premio de científico senior ; en los años siguientes, la ISCB ha buscado nominaciones para becarios de sus miembros. Los becarios se presentan tradicionalmente en la conferencia insignia de Sistemas Inteligentes para Biología Molecular de la ISCB cada año. A partir de la promoción de 2017, se han elegido 64 becarios. [14]
Comunidades de interés especial (COSI)
Las comunidades de interés especial de ISCB (COSI) son comunidades miembros de interés compartido que se han autoorganizado y tienen múltiples actividades o interacciones a lo largo del año, en lugar de reunirse únicamente durante el programa SIG de la conferencia ISMB. [15] Un objetivo importante de cualquier COSI es fomentar una comunidad colaborativa centrada en un tema en la que los científicos se comuniquen entre sí sobre problemas y / u oportunidades de investigación en áreas específicas de la biología computacional. Dicha comunicación a menudo se realiza en forma de reuniones, pero también puede ser a través de otras herramientas de redes sociales que permiten una participación vibrante en un entorno virtual.
Consejo estudiantil
En 2004, Manuel Corpas fundó el Consejo de Estudiantes de ISCB para promover el desarrollo de una comunidad mundial de estudiantes de biología computacional. Una de las funciones principales del consejo de estudiantes es promover las habilidades blandas para desarrollar el potencial de los aprendices de bioinformática y biología computacional. A partir de 2017[actualizar], el consejo estudiantil representa a más de 1,000 estudiantes en todo el mundo. [ cita requerida ]
Conferencias
ISCB surgió de la necesidad de una estructura organizativa estable para apoyar la planificación y la gestión de las finanzas de la serie de conferencias de Sistemas Inteligentes para Biología Molecular (ISMB), que tuvo su inicio en 1993. ISMB es la actividad anual más destacada de ISCB, hacia la cual un una parte importante de los recursos se dedica cada año. Desde 2004, cuando ISMB se celebra en Europa, se realiza conjuntamente con la Conferencia Europea de Biología Computacional (ECCB).
ISCB comenzó a expandir sus ofertas de conferencias con la introducción de la serie anual de conferencias de bioinformática de las Montañas Rocosas en 2003, la conferencia sobre semántica en el cuidado de la salud y las ciencias biológicas ( CSHALS ) en 2008, la conferencia bianual de bioinformática de ISCB Africa ASBCB en 2009 y la bi -Conferencia anual de ISCB en América Latina en 2010. ISCB también organiza una Conferencia anual de bioinformática de Great Lake y se asocia con RECOMB para producir la Conferencia de genómica regulatoria y de sistemas con DREAM Challenges. La reunión ISCB-Asia se inició en 2012 y continúa tomando forma después de su última conferencia en 2014 en Japón junto con GIW.
Además de las conferencias organizadas por ISCB, la sociedad apoya otras conferencias de biología computacional y bioinformática a través de afiliaciones y patrocinios. Estos incluyen el Pacific Symposium on Biocomputing (PSB) anual, la conferencia internacional anual sobre Investigación en Biología Molecular Computacional (RECOMB), la Conferencia Internacional anual sobre Bioinformática (InCoB) y la reunión general anual de la Red Europea de Biología Molecular o EMBnet.
Revistas oficiales
- En 1998, la bioinformática se convirtió en la revista oficial de la ISCB. [8] Los miembros de la sociedad que pagan cuotas se beneficiaron de una suscripción en línea a la revista. Las actas de conferencias de ISMB se han publicado en Bioinformatics desde 2001. [16] [17] En 2004, como muchos miembros de ISCB tenían suscripciones institucionales a Bioinformatics , ISCB decidió no renovar su contrato con la revista. [8] [9] En enero de 2009, la bioinformática se convirtió nuevamente en una revista oficial de la ISCB, junto con PLOS Computational Biology . [18]
- PLOS Computational Biology es una revista de acceso abierto revisada por pares que publica mensualmente la Public Library of Science (PLOS). Se convirtió en un diario oficial de ISCB en 2005. [9]
- En 2015, ISCB anunció la formación de ISCB Community Journal , un canal dedicado en la plataforma de publicación en línea F1000Research , que brinda a los miembros la oportunidad de publicar artículos de investigación abiertamente independientemente de su formato o impacto percibido. [19] [20]
Organizaciones afiliadas
La ISCB tiene varias organizaciones afiliadas (principalmente regionales), incluida la Red Europea de Biología Molecular (EMBnet), el Centro de Bioinformática de los Países Bajos (NBIC), la Sociedad Africana de Bioinformática y Biología Computacional y la Sociedad Japonesa de Bioinformática . [21]
La ISCB también es miembro fundador de la Organización Global para el Aprendizaje, Educación y Capacitación en Bioinformática (GOBLET) . En colaboración con GOBLET, el ISCB está involucrado en el desarrollo de competencias básicas para diferentes tipos de aprendices de bioinformática; estas competencias se están utilizando en el desarrollo de nuevos planes de estudio de bioinformática. [22] [23] [24]
Referencias
- ^ "Contáctenos" . www.iscb.org . Consultado el 11 de agosto de 2016 .
- ^ "Membresía ISCB" . www.iscb.org . Consultado el 11 de agosto de 2016 .
- ^ Fogg, Christiana N .; Kovats, Diane E. (2014). "La Sociedad Internacional de Biología Computacional honra a Dana Pe'er con el premio Top Bioinformática / Biología Computacional para 2014" . PLOS Biología Computacional . 10 : e1003682. doi : 10.1371 / journal.pcbi.1003682 . PMC 4063598 . PMID 24945496 .
- ^ Fogg, CN; Kovats, DE (2014). "2014 logro ISCB por un premio científico senior: Gene Myers" . Biología Computacional PLoS . 10 (5): e1003621. doi : 10.1371 / journal.pcbi.1003621 . PMC 4031058 . PMID 24853264 .
- ^ http://www.iscb.org/iscb-awards/accomplishment-senior-scientist-award Logro por un premio científico senior
- ^ "Premio al Innovador ISCB" . www.iscb.org . Consultado el 2 de febrero de 2017 .
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- ^ a b c Hunter, Lawrence; Altman, Russ B .; Bourne, Philip E. (2007). "10º aniversario de la Sociedad Internacional de Biología Computacional" . Biología Computacional PLoS . 3 (6): e135. doi : 10.1371 / journal.pcbi.0030135 . PMC 1904389 .
- ^ a b c d e "Historia de ISCB" . www.iscb.org . Consultado el 27 de octubre de 2017 .
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- ^ "13 de febrero de 2017: la Sociedad Internacional de Biología Computacional nombra a siete miembros como la clase de becarios de ISCB de 2017" . www.iscb.org . Consultado el 13 de febrero de 2017 .
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