Deoxyribonuclease IV (inducida por fago T4) ( EC 3.1.21.2 , endodesoxirribonucleasa IV (fago T4 inducida) , E. coli endonucleasa IV , endodesoxirribonucleasa , redoxyendonuclease , deoxriboendonuclease , Escherichia coli endonucleasa II , endonucleasa II , DNA-adenina-transferasa ) es un tipo de endonucleasa que cataliza los nucleótidos de degradación [1] en el DsDNA atacando el extremo 5'-terminal. [2] [3] [4]
La desoxirribonucleasa IV es un tipo de desoxirribonucleasa que funciona en sitios abásicos o apurínicos-apirimidininc cuando la célula está experimentando una vía de reparación por escisión de nucleótidos . [5] Además, la endonucleasa IV consta de varias actividades como AP endonucleasa, 3'-diesterasa, 3 '-> 5' exonucleasa y 3'fosfatasa. [6]
La endonucleasa IV está codificada por denB del bacteriófago T4 y su secuencia de unión es 5′-dT || dCdAdCdTdTdC-3 ′. Se ha descubierto que el residuo de serina 176 juega un papel crucial en el aumento de la tasa de hidrólisis de la endonucleasa de una secuencia consenso que contiene citidina. La endonucleasa IV pertenece a miembros que se asemejan estructuralmente a la endonucleasa I de apyrimidininc (APE1). [7]
La desoxirribonucleasa IV se aisló por primera vez de tejidos de conejo en 1968 y se determinó que su peso molecular era de 42.000 dalton . Se descubrió que esta enzima se asemeja a varias actividades de endonucleasa microbiana de la ADN polimerasa que encontré en Escherichia coli , que parecen ser necesarias para la reparación y recombinación del ADN. [8]
La DNasa IV está compuesta por 185 residuos de aminoácidos con iones de magnesio que actúan como cofactor. Ión metálico diavalente tal como Mg²⁺ que actúa como cofactor durante la escisión de 5'-mononucleótidos. [9] Su núcleo de barril beta TIM rodeado por hélices con tres iones metálicos, ya sea tres Zn2 + o dos Zn2 + y un Mn2 +, que desempeña un papel crucial en la reparación de la escisión AP. [10]
El 70% de la actividad DNasa IV total se encontró en el citoplasma mientras que el 30% se encontró en los núcleos celulares. [1] En el cuerpo humano, se requirió DNasa IV para la escisión de un intermedio de reacción generado por el desplazamiento de la hebra de la plantilla durante el llenado de espacios. [11]