El Papa Juan Pablo II creó la Diócesis Católica Romana de Kannur en la Provincia Eclesiástica de Verapoly en India mediante la bifurcación de la Diócesis de Calicut el 9 de diciembre de 1998. La nueva Diócesis está formada por católicos latinos de Malabar que residen en los distritos fiscales de Kannur y Kasaragod .
La sede estuvo vacante desde 2012 hasta 2014. El 1 de febrero de 2014, el Papa Francisco nombró a Alex Joseph Vadakumthala como nuevo obispo de Kannur. Fue consagrado el 23 de marzo.
La diócesis de Kannur comprende el territorio del distrito civil de Kannur al norte del río Mahé , excluyendo Palloor , Chalakkara, Pandakkal y Cherukallai que pertenecen al municipio de Mahe y el territorio del distrito civil de Kasaragod que cae al sur de Chandragiri río . La erección de esta diócesis fue un acontecimiento histórico para Kannur que tiene 500 años de tradición cristiana . El establecimiento de esta diócesis, en la auspiciosa ocasión del Jubileo de Platino de la Diócesis de Calicut, fue recibido con júbilo por la gente que considera la diócesis de Kannur como un regalo de Dios para esta región de la India.
Aunque las comunidades cristianas existieron en el sur y el centro de Kerala desde el comienzo del cristianismo , el norte de Kerala, conocido como Malabar, tuvo que esperar mucho tiempo hasta el advenimiento de los misioneros europeos para comenzar su evangelización hasta el siglo XVI. Fue con la llegada del navegante portugués Vasco de Gama , que desembarcó aquí el 20 de mayo de 1498, que los misioneros tuvieron acceso a esta zona. Padre Pedro de Kovilaham, el primer misionero que llegó a Malabar con Vasco de Gama murió el 31 de julio de 1498. Como los comerciantes portugueses no se llevaban bien con el gobernante de Calicut, "el Zamorin", se trasladaron a Kannur y los "Kolathiri", el rey de Kannur les dio la bienvenida.
A los cuatro misioneros franciscanos con Hovavo Nova, su líder de grupo, se les permitió construir una capilla en Kannur. (Este es el lugar donde se encuentra la Catedral de la Santísima Trinidad de la Diócesis de Kannur). En 1505, el virrey portugués, Francisco de Almeida, estableció el famoso fuerte de San Ángelo y construyó allí la iglesia de Santiago.
El Papa Juan Pablo II por el Breve Apostólico Ad Perpetuam Rei Memoriam , fechado el 5 de noviembre de 1998, creó la Diócesis de Kannur a partir de la Diócesis de Calicut. El mismo día, Varghese Chakkalakal, que era profesor en el Seminario de San José, Mangalore , y sacerdote de la diócesis de Calicut, fue elegido obispo de Kannur y el obispo electo fue consagrado el 7 de febrero de 1999 y se hizo cargo de la diócesis. el 8 de febrero de 1999. El obispo ha tomado como lema "según tu voluntad" "Daivathirumanassinu Vidheyathuvam". El lunes 15 de junio de 2012, el Papa Benedicto XVI lo transfirió para que se convirtiera en obispo de la diócesis católica romana de Calicut , India; será el Administrador Apostólicode la Diócesis durante el período de sede vacante hasta que el Papa elija un sucesor.