DOMINE es una base de datos de interacciones de dominio de proteínas conocidas y predichas (o interacciones dominio-dominio). [1] Contiene interacciones observadas en estructuras cristalinas PDB y aquellas predichas por varios enfoques computacionales. DOMINE utiliza perfiles Pfam HMM para las definiciones de dominio de proteínas . La base de datos DOMINE contiene 26.219 interacciones entre 5.410 dominios ), que incluye 6.634 interacciones conocidas inferidas de datos de estructura PDB .
Contenido | |
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Descripción | colección completa de interacciones dominio-dominio conocidas y predichas. |
Contacto | |
Centro de Investigación | Instituto Nacional de Ciencias de la Salud Ambiental , Institutos Nacionales de Salud |
Laboratorio | Biologia de sistemas |
Cita primaria | Yellaboina y col. (2011) [1] |
Fecha de lanzamiento | 2010 |
Acceso | |
Sitio web | https://manticore.niehs.nih.gov/domine |
Referencias
- ^ a b Yellaboina; et al. (Enero de 2011). "DOMINE: una colección completa de interacciones dominio-dominio conocidas y previstas" . Ácidos nucleicos Res . Inglaterra. 39 (Problema de la base de datos): D730-5. doi : 10.1093 / nar / gkq1229 . PMC 3013741 . PMID 21113022 .