DsrA RNA es un RNA no codificante que regula tanto la transcripción , al superar el silenciamiento transcripcional de la proteína H-NS asociada a nucleoide , [1] como la traducción , al promover la traducción eficiente del factor sigma de estrés, RpoS . [2] [3] Estas dos actividades de DsrA pueden separarse por mutación: el primero de los tres bucles de tallo del ARN de 85 nucleótidos es necesario para la traducción de RpoS pero no para la acción anti-H-NS, mientras que el segundo bucle de tallo es esencial para el antisilenciamiento y menos crítico para la traducción de RpoS. El tercer bucle de tallo, que se comporta como un terminador de la transcripción, puede sustituirse por el terminador de la transcripción trp sin pérdida de ninguna de las funciones de DsrA. La secuencia del primer bucle de tallo de DsrA es complementaria con la porción líder aguas arriba del ARN mensajero de RpoS, lo que sugiere que el emparejamiento de DsrA con el mensaje de RpoS podría ser importante para la regulación de la traducción. Las estructuras del complejo DsrA y DsrA/rpoS fueron estudiadas por RMN. El estudio concluyó que el sRNA contiene un equilibrio conformacional dinámico para su segundo tallo-bucle que podría ser un mecanismo importante para que DsrA regule las traducciones de sus mRNA objetivo múltiples. [4]
Existe evidencia de que el ARN DsrA puede autoensamblarse en nanoestructuras a través de interacciones antisentido de tres regiones autocomplementarias. [5] [6]
Existe evidencia experimental que sugiere que DsrA interactúa con los genes que codifican proteínas hns, [7] [8] [9] rbsD, [7] argR , [7] ilvI [7] y rpoS [10] [11] [12 ] [13] a través de un mecanismo antisentido .
DsrA se pliega en una estructura con tres horquillas . El segundo de estos ( nucleótidos 23–60) se une a Hfq . [14]