En biología molecular, el represor de arginina ( ArgR ) es un represor de las vías de la arginina deiminasa procariótica .
La vía de la arginina dihidrolasa (AD) se encuentra en muchos procariotas y algunos eucariotas, siendo un ejemplo de estos últimos la Giardia lamblia ( Giardia intestinalis ). [1] La vía anaeróbica de tres enzimas descompone la L-arginina para formar 1 mol de ATP, dióxido de carbono y amoníaco . En algunas bacterias, la primera enzima, la arginina deiminasa , puede representar hasta el 10 % de la proteína celular total . [1]
La mayoría de las vías de la arginina deiminasa procariótica están bajo el control de un gen represor , denominado ArgR. [2] Este es un regulador negativo y solo liberará el operón de arginina deiminasa para su expresión en presencia de arginina. [3] La estructura cristalina de apo-ArgR de Bacillus stearothermophilus ha sido determinada a 2.5A por medio de cristalografía de rayos X. [4] La proteína existe como un hexámero de subunidades idénticas y se muestra que tiene seis dominios de unión al ADN, agrupados alrededor de un núcleo oligomérico central cuando se une a la arginina. predominantemente interactúacon residuos de AT en cajas ARG. Esta proteína hexamérica se une al ADN en su extremo N para reprimir la biosíntesis de arginina o activar el catabolismo de arginina . Algunas especies tienen varios parálogos de ArgR . En un árbol de unión de vecinos, algunas de estas secuencias parálogas muestran ramas largas y difieren significativamente de la región C-terminal bien conservada.