Duopalatinus se clasifica en el " clado Calophysus - Pimelodus ". Dentro de este clado, se considera parte del " grupo Pimelodus " de Pimelodids, que también incluye a Pimelodus , Exallodontus , Cheirocerus , Iheringichthys , Bergiaria , Bagropsis , Parapimelodus , Platysilurus , Platystomatichthys y Propimelodus . [2]
Las especies de Duopalatinus se distribuyen en América del Sur . D. emarginatus habita en la cuenca del río São Francisco . [3] D. peruanus se encuentra en las cuencas de los ríos Amazonas y Orinoco . [4]