Exonucleasa III
| Exonucleasa III | ||||||
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 Estructura cristalina de la exonucleasa III de E. coli . [1] [2] | ||||||
| Identificadores | ||||||
| Organismo | ||||||
| Símbolo | xthA | |||||
| Alt. simbolos | ExoIII | |||||
| Entrez | 946254 | |||||
| RefSeq (Prot) | NP_416263 | |||||
| UniProt | P09030 | |||||
| Otros datos | ||||||
| Número CE | 3.1.11.2 | |||||
| Cromosoma | genoma: 1,83 - 1,83 Mb | |||||
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La exonucleasa III (ExoIII) es una enzima que pertenece a la familia de las exonucleasas . ExoIII cataliza la eliminación gradual de mononucleótidos de los terminales 3´-hidroxilo del ADN de doble hebra . [1] Se elimina un número limitado de nucleótidos durante cada evento de unión, lo que resulta en deleciones progresivas coordinadas dentro de la población de moléculas de ADN . [2]
Función
Los sustratos preferidos son extremos 3 'romos o rebajados, aunque ExoIII también actúa en las muescas en el ADN dúplex para producir huecos de una sola hebra. La enzima no es activa en el ADN monocatenario y, por tanto, los extremos que sobresalen en 3 'son resistentes a la escisión. El grado de resistencia depende de la longitud de la extensión, siendo las extensiones de 4 bases o más esencialmente resistentes a la escisión. Esta propiedad se utiliza para producir deleciones unidireccionales a partir de una molécula lineal con un terminal resistente (saliente 3 ') y uno susceptible (saliente romo o saliente 5'). [3]
La actividad de ExoIII depende parcialmente de la estructura helicoidal del ADN [4] y muestra dependencia de secuencia (C> A = T> G). [5]
También se ha informado que ExoIII tiene actividades de RNasa H, 3´-fosfatasa y AP-endonucleasa. [1]
Estudios actuales
Hay muchas exonucleasas diferentes y aún quedan muchas por descubrir en bacterias; los estudios actuales se están llevando a cabo en E. coli . Muchas exonucleasas caen en superfamilias con diferentes dominios de la vida, lo que demuestra que la exonucleasa III ha demostrado ser antigua. Las exonucleasas evolucionaron temprano en la historia de la vida y tienen funciones biológicas vitales. [6]
Regulación
La temperatura , la concentración de sal y la proporción de enzima a ADN afectan en gran medida la actividad de la enzima, lo que requiere que las condiciones de reacción se adapten a aplicaciones específicas.
Referencias
- ^ a b c PDB : 1ako ; Mol CD, Kuo CF, Thayer MM, Cunningham RP, Tainer JA (marzo de 1995). "Estructura y función de la enzima de reparación de ADN multifuncional exonucleasa III". Naturaleza . 374 (6520): 381–6. Código Bibliográfico : 1995Natur.374..381M . doi : 10.1038 / 374381a0 . PMID 7885481 .
- ^ a b Imagen renderizada en MacPyMOL © 2006 DeLano Scientific
- ^ Rogers SG, Weiss B (1980). "Exonucleasa III de Escherichia coli K-12, una AP endonucleasa" . Métodos en enzimología. 65 (1): 201-11 . doi : 10.1016 / S0076-6879 (80) 65028-9 . ISBN 978-0-12-181965-1. PMID 6246343 . Cite journal requiere
|journal=( ayuda ) - ^ Maniatis T, Sambrook J, Fritsch EF (1989). Clonación molecular: un manual de laboratorio (2ª ed.). Cold Spring Harbor, Nueva York: Laboratorio de Cold Spring Harbor. págs. 5.84–5 . ISBN 978-0-87969-309-1.
- ^ Henikoff S (junio de 1984). "La digestión unidireccional con exonucleasa III crea puntos de corte específicos para la secuenciación del ADN". Gene . 28 (3): 351–9. doi : 10.1016 / 0378-1119 (84) 90153-7 . PMID 6235151 .
- ^ Lovett ST (diciembre de 2011). "Las exonucleasas de ADN de Escherichia coli" . EcoSal Plus . 4 (2). doi : 10.1128 / ecosalplus.4.4.7 . PMC 4238392 . PMID 26442508 .
Otras lecturas
- Richardson CC, Lehman IR, Kornberg A (enero de 1964). "Una fosfatasa-exonucleasa de ácido desoxirribonucleico de Escherichia coli . II. Caracterización de la actividad exonucleasa" (PDF) . La revista de química biológica . 239 (1): 251–8. PMID 14114851 .
- Linxweiler W, Hörz W (agosto de 1982). "Especificidad de secuencia de exonucleasa III de E. coli" . Investigación de ácidos nucleicos . 10 (16): 4845–59. doi : 10.1093 / nar / 10.16.4845 . PMC 320823 . PMID 6752885 .
- EC 3.1
