Nacida en Dugny de una familia de músicos, Malgoire comenzó su carrera bajo el liderazgo de su padre Jean-Claude Malgoire dentro de La Grande Écurie et la Chambre du Roy y de su maestro Sigiswald Kuijken con La Petite Bande . Desde 1987, ha ocupado puestos de violín solista en conjuntos barrocos como La Chapelle Royale de Philippe Herreweghe , Les Talens Lyriques de Christophe Rousset y Les Arts florissants de William Christie .
En 2003, fundó "Les Dominos", [1] un conjunto de geometría variable, especializado en música de los siglos XVII y XVIII, que actuó en Nápoles, Beaune, Ginebra, Lille, etc. Para profundizar en su obra sonata, Malgoire cofundó Les Nièces de Rameau , conjunto orientado al repertorio de música de cámara .
Paralelamente a su carrera en solitario, Malgoire está interesada en la dirección musical: después de la radio en la Suiza francófona , para la que fue invitada a dirigir los motetes de Jean-Philippe Rameau en el Festival Agapé, dirigió Jean-Féry Rebel , Georg Friedrich Haendel y Bach, pero también el Réquiem de Mozart y Heinrich Biber .
Especialista europeo del violín antiguo, Malgoire interviene de Sablé a Tokio pasando por la Fundación Royaumont, la Juilliard School de Nueva York y Río de Janeiro. Desde 2000, enseña violín antiguo y música de cámara en el Conservatorio de Ginebra y en la Schola Cantorum de París .