La decimotercera temporada de la serie de televisión dramática de ficción estadounidense ER se emitió por primera vez el 21 de septiembre de 2006 y concluyó el 17 de mayo de 2007. Consta de 23 episodios.
Tras el tiroteo, Abby da a luz a un bebé prematuro mientras Sam sufre una terrible experiencia a manos de su exnovio. Mientras tanto, Kerry Weaver, el personaje que lleva más tiempo en el programa, se marcha cuando Kovač se ve obligada a hacer recortes presupuestarios que amenazan su trabajo. El paramédico Tony Gates regresa como el nuevo interno de la sala de emergencias, Kovač es demandado por negligencia y luego se ve obligado a regresar a Croacia para cuidar a su padre, Abby lucha por adaptarse a la maternidad y Ray se ve involucrado en un accidente que le cambia la vida y le da un vuelco al mundo de Neela. abajo.
El personal del hospital se enfrenta a las secuelas inmediatas del tiroteo. Weaver encuentra a Abby inconsciente y Kovač atado a una camilla. El trauma de Abby la pone en trabajo de parto prematuro, y cuando el riesgo de desprendimiento de placenta se convierte en realidad, su bebé nace dos meses y medio antes de tiempo. Cuando el sangrado continúa, Abby se somete a una histerectomía.. El corazón de Jerry fue atravesado por una bala y debe someterse a una cirugía, que Dubenko y Neela realizan con éxito. Después de una dura persecución de la policía local, Steve y sus cómplices deciden esconderse con los rehenes Sam y Alex. Finalmente, Steve dispara a los dos co-conspiradores, que quieren deshacerse de Sam y Alex, y luego le dice a Sam que preferiría que toda su familia estuviera muerta antes que ser separados de nuevo. Más tarde esa noche, después de que Alex se duerme en la camioneta, Steve viola a Sam. Cuando Steve se duerme, Sam toma las llaves de la camioneta y se prepara para escapar con Alex, pero luego regresa, toma el arma de Steve y le dispara tres veces.
El Dr. Pratt difiere del Rev. Watkins sobre la clínica de la iglesia y se enfrenta a una audiencia ante la junta. La preocupación de Lockhart por Eddie provoca tensión entre ella y Kovač en el trabajo. Barnett discute con Gates y Neela por el tratamiento de uno de los dos niños heridos en un accidente de motonieve; el padre asume que fue culpa del hijastro y el hijastro no le cuenta la verdadera historia. Tony todavía no le ha dicho a Sarah que se mudará. Alex cae más profundamente en una rebelión hosca. Kerry se despide.
Luka se va a Croacia para visitar a su padre enfermo. Ray todavía está MIA. Moretti aceptó el trabajo de Jefe de Urgencias y pasa su primer día auditando procedimientos. Gates pierde su intento de obtener la custodia de Sarah (sus abuelos llegan con documentos legales exigiendo la custodia); se queda para asegurarle a una Sarah llorosa que la verá tan a menudo como pueda. Un veterano de la guerra de Irak adicto a las drogas resulta haber sido intérprete en las sesiones de tortura. Neela finalmente recibe una llamada del celular de Ray desaparecido. Ella va a verlo en un hospital, solo para descubrir que le han amputado ambas piernas debido a su accidente.