QIAGEN Silicon Valley (anteriormente conocido como Ingenuity Systems , Inc) es una empresa con sede en Redwood City, California , EE. UU., Para analizar sistemas biológicos complejos. El primer producto de QIAGEN Silicon Valley, IPA, se introdujo en 2003 y se utiliza para ayudar a los investigadores a analizar datos ómicos y modelar sistemas biológicos. El software ha sido citado en miles de publicaciones científicas de biología molecular y es una de las varias herramientas para los investigadores de biología de sistemas y bioinformáticos en el descubrimiento de fármacos y la investigación institucional.
Todo el Silicon Valley de QIAGEN utiliza la Base de conocimientos Ingenuity, que contiene interacciones biológicas y químicas y anotaciones funcionales creadas a partir de millones de relaciones modeladas individualmente entre proteínas, genes, complejos, células, tejidos, fármacos y enfermedades. [ cita requerida ] Cada relación se origina a partir de hechos experimentales informados de fuentes de literatura primaria, incluidos artículos de revistas revisados por pares [ cita requerida ] y libros de texto [ cita requerida ] . El proceso de adquisición y extracción de conocimiento está protegido por múltiples patentes de EE. UU. [1]
IPA se adopta ampliamente [¿ según quién? ] en la comunidad de las ciencias de la vida y se ha citado en miles de artículos de revistas revisados por pares. [2] IPA se puede utilizar con o sin datos. IPA ayuda a los investigadores a analizar datos derivados de microarrays de expresión y SNP , experimentos de proteómica y experimentos a pequeña escala que generan listas de genes, con el fin de obtener información sobre las interacciones moleculares y químicas, los fenotipos celulares y los procesos de enfermedades dentro de un sistema. La API también permite a los investigadores buscar información sobre genes, proteínas, sustancias químicas, fármacos y reactivos.. La información resultante se puede utilizar para construir modelos biológicos, diseñar experimentos o ponerse al día en un área de investigación. [3]
Ingenuity ofrece herramientas de búsqueda y visualización para sitios web de comercio electrónico relacionados con la ciencia. Ingenuity tiene dos asociaciones destacadas. Sigma-Aldrich aprovecha la tecnología Ingenuity en su aplicación Your Favorite Gene , y BD Biosciences aprovecha la tecnología Ingenuity en su aplicación BD Cell Pathways [4] .
2003 - Ingenuity ofrece por primera vez la base de conocimientos de Ingenuity [5]
2004 - La Universidad de Stanford otorga licencias a IPA [6]
2004 - Un análisis independiente encuentra un ROI significativo para las empresas farmacéuticas que utilizan IPA [7]
2005 - La Administración de Alimentos y Medicamentos de EE. UU. Adopta el IPA para revisar las presentaciones de farmacogenómica [8 ]
2006 - Ingenuity se asocia con Asuragen, Spotfire, Agilent, Genedata e Inforsense [9]
2007 - Ingenuity presenta capacidades de toxicología y biomarcadores dentro de IPA 5.0 [10]
2007 - IPA 5.0 gana Best in Show - Mejor producto nuevo en Bio- Mundo de TI [11]
2007 - Ingenuity y FDA establecen una colaboración de tres años para mejorar el proceso de revisión regulatoria [12]
2008 - La característica más nueva de IPA, Path Designer, gana el premio al Mejor Producto Nuevo en Medicina Molecular [13]
2009 - Sigma Aldrich lanza Your Favorite Gene - Powered by Ingenuity [14 ]
2009 - BD Biosciences lanza BD Cell Pathways, impulsado por Ingenuity [15]
2011 - Ingenuity anuncia acceso anticipado a Ingenuity iReport [16]
2012 - Ingenuity anuncia la disponibilidad comercial de Ingenuity iReport e Ingenuity Variant Analysis [17] [18]
2013 - Ingenuity anuncia colaboraciones con Laboratory Corporation y Quest Diagnostics para desarrollar una solución para puntuar la variación genética para los datos de secuenciación de próxima generación (NGS) y es adquirida por QIAGEN en mayo del mismo año