En 1551, el hermano de Mohamed III, Hasan IX se convirtió en sultán. Renunció al Islam y se convirtió al cristianismo . Fue depuesto tras la conversión y posteriormente conocido con el nombre lusitano de Dom Manoel. Entonces ocurrió el primer interregno y Maldivas fue gobernada por un Consejo de Ministros de 1552 a 1554.
Ali IV se convirtió en sultán en 1557, quien murió en la batalla. El rey Dom Manoel (in absentia) fue restaurado como rey en 1558, antes conocido como Sultán Hasan IX. Un católico maldivo llamado Andiri Andirin actuó como su regente, mientras que Manoel vivía en Goa. Entonces Maldivas gobernado por Kateeb Muhammad Thakurufaanu Al Auzam de Utheemu después de que asesinó a Andiri Andirin, el regente del rey Dom Manoel. Según un tratado, se refugió de Ali Raja de Cannanore, la base de operaciones de Muhammad Thakurufaanu era Minicoy bajo la soberanía de Cannanore. Keteeb Muhammad Thakurufaanu no cumplió esta promesa. El Ali Raja exigió el dominio sobre las Maldivas, como le prometió el Kateeb de Uteemu .
La naturaleza de la relación entre Kateeb Muhammad Thakurufaanu y Ali Raja de Cannanore se describió en una carta enviada por una posterior Ali Raja, Mariambe Ali-Adi Raja Bibi, al sultán Mohamed Mueenuddine I de las Maldivas. La carta estaba fechada el viernes 17 de Jamada-el-oula Anno Hegirae 1243 (7 de diciembre de 1827 d.C.). Según la carta, Mohamed Thakurufan había firmado un tratado en el que cede la soberanía de las Maldivas al Ali Raja de Cannanore en caso de que Thakurufaanu se estableciera en el poder en Malé. [1]
Kateeb Muhammad Thakurufaanu concluyó un tratado con el rey Dom Manoel para protegerse del Ali Raja de Cannanore con cuya ayuda Kateeb tomó el poder en Malé. [2]
De 1752 a 1757, el sultán Muhammad Imaduddin III estuvo cautivo en la isla de Kavaratti hasta su muerte en 1757. En 1752, fue apresado por Ali Raja de Cannanore y transportado a la isla de Kavaratti en las Laccadivas . Male estaba ocupado. La ocupación fue terminada por Muleegey Dom Hasan Maniku, un descendiente directo del penúltimo rey cristiano Joao. El sultán murió en cautiverio. Durante este tiempo, Maldivas fue gobernada por la sobrina del sultán cautivo Amina I de Maldivas y su hija, Amina II. El regente de facto era Muleegey Dom Hassan Maniku. La regencia continuó a la espera del regreso del cautiverio del heredero del sultán fallecido.
En 1766, después de una restauración, Muhammed Ghiya'as ud-din se convirtió en sultán. Depuso mientras estaba en la peregrinación del Hayy . Un nuevo período de interregno comenzó en 1773 y la hermana mayor del sultán, Amina I, volvió a ser regente. Su esposo Ali Shahbandar tomó el poder durante su regencia, y la dinastía Dhiyamigili perdió el trono en la cascada de eventos que siguieron. Muhammad Manikfaanu de Huraa usurpó el trono y luego abdicó en favor de su sobrino, quien se convirtió en sultán Muizzuddin. Amina y su esposo fueron desterrados a una isla remota en el atolón de Laamu . El interregno terminó dramáticamente y la dinastía Huraa asumió el poder. [3]