Nació en Irlanda. Su abuelo, Thomas Hooke (fallecido en 1672), era un comerciante que apoyó al Parlamento durante las guerras civiles de la década de 1640 y que se convirtió en alcalde de Dublín en 1654. Su padre, también llamado John Hooke, era un ministro protestante inconformista.
La educación de Hooke incluyó la escuela primaria en Kilkenny College y la universidad en Trinity College Dublin . En 1675 se trasladó a Inglaterra para realizar estudios jurídicos en Gray's Inn en Londres, y se graduó como abogado en 1681. Se casó con Elizabeth Lambert, hija del general parlamentario John Lambert encarcelado . El matrimonio trajo conexiones útiles dentro de los círculos comerciales y la carrera legal de Hooke floreció.
Habiendo comprado tierras en West New Jersey y considerado emigrar a Estados Unidos durante el reinado del rey James II, Hooke decidió permanecer en Inglaterra después de que la Revolución de 1688 llevó al poder a Guillermo de Orange . Ganando el favor del nuevo régimen, fue ascendido para servir como juez en el norte de Gales en 1689. Se convirtió en el juez superior en el área en 1695 y agregó un puesto a Chester a sus otras funciones.
La religión de Hooke había cambiado de las creencias inconformistas de su padre y su abuelo al anglicanismo dominante. Se convirtió en uno de los fundadores de la Sociedad para la Propagación del Conocimiento Cristiano (SPCK) en 1699 y permaneció involucrado en el funcionamiento de la SPCK durante muchos años. Nuevamente hizo amigos y contactos influyentes en los círculos políticos, comerciales y legales de Londres. En una carta de 1710 a Robert Harley , ministro principal de la administración de la reina Ana, Hooke se negó a declararse Whig o Tory en política. Esta negativa a identificarse claramente con uno u otro de los partidos principales puede haber complicado los últimos años de la vida de Hooke.
Fue perseguido por la controversia y estuvo involucrado en complicadas acciones legales desde 1707 hasta el final de su vida. Acusado de aceptar obsequios contrarios a las normas que rigen su cargo como juez, fue investigado por una comisión de la Cámara de los Comunes. Aunque fue exonerado en una votación de la Cámara, su posición se vio aún más socavada por una amarga disputa con Daniel Coxe, su ex socio en la inversión de tierras en Nueva Jersey, que terminó en la Cancillería de Londres.
Hooke murió en 1712 sin ninguna controversia resuelta satisfactoriamente. Escribió un libro sobre religión, Catolicismo sin papismo: ensayo para convertir a la Iglesia de Inglaterra en un medio y un patrón de unión al mundo cristiano (Londres, 1699).