Nació en Escocia a principios del siglo XVI y se graduó en una universidad escocesa. De 1532 a 1534 fue prior del convento dominico de Perth; pero habiendo sido convocado en el último año con Alexander Ales y otros para responder por herejía ante el obispo de Ross, se fue a Inglaterra . Allí se le concedieron cartas de denización el 7 de abril de 1537 y se casó con Agnes Macheson , una compañera exiliada por religión; su hermana Elizabeth se convirtió en la esposa de Miles Coverdale .
La reacción de 1539 convirtió a Inglaterra en un refugio dudoso y el 25 de noviembre de 1540 MacAlpine se matriculó en la universidad de Wittenberg . Ya se había graduado de BA en Colonia , y en 1542 procedió a su doctorado en Wittenberg. en ese año, siendo conocido como Macabeo, aceptó la oferta de Christian III de Dinamarca para la cátedra de teología en la universidad de Copenhague , que había sido dotada con el botín de la Iglesia.
Melanchthon habló bien de Macalpine y con Peter Plade (Palladius) que había estudiado en Wittenberg, Macalpine tuvo un papel destacado en la construcción de la Iglesia Luterana de Dinamarca. Animó a Sir David Lindsay, que lo visitó en 1548, a publicar su Monarchie ; y persuadió a Christian III para que intercediera ante María I de Inglaterra en nombre de Coverdale y lo invitara a Dinamarca.
Una exposición conjunta de Plade y MacAlpine sobre los errores de Osiander se publicó en 1552 y se reimprimió en Leipzig y Copenhague en 1768. MacAlpine fue uno de los cuatro traductores de la Biblia alemana de Lutero al danés.