Besos de tallo-lazo


En el ARN se forma una interacción tallo-bucle de beso, o interacción de bucle de tallo que se besa, cuando dos bases entre dos bucles de horquilla se emparejan. Estas interacciones de besos intra e intermoleculares son importantes en la formación de la estructura terciaria o cuaternaria de muchos ARN. [2]

Las interacciones de beso de ARN, también llamadas pseudonudos bucle-bucle , ocurren cuando los nucleótidos desapareados en un bucle en horquilla, par de bases con los nucleótidos no emparejados en otro bucle en horquilla. [3] Cuando los bucles de horquilla se encuentran en moléculas de ARN separadas, su interacción intermolecular se denomina complejo de besos. Estas interacciones generalmente se forman entre bucles de tallo. Sin embargo, se han observado complejos estables que contienen sólo dos pares de bases intermoleculares Watson-Crick . [4] [5]

Las moléculas de ácido ribonucleico (ARN) cumplen su función en las células vivas adoptando estructuras tridimensionales específicas y muy complejas. Se cree que los bucles de besos pueden iniciar la recombinación. La recombinación es fundamental para una evolución exitosa, especialmente en la adaptación y supervivencia de los virus. [6] [7]

Los retrovirus son virus que tienen una estructura muy similar, lo que les permite replicarse silenciosamente dentro de un anfitrión, manteniéndolo vivo hasta que se complete la replicación y el anfitrión ya no sea necesario. El ARN genómico de los retrovirus está unido de forma no covalente a la estructura de enlace dímero (DLS), una región no codificante en el 5 'UTR. Para que se produzca la interacción del bucle de besos, hay una interacción triple que implica una purina flanqueante en 5 'y 2 bases centralizadas en la hebra complementaria. Esta interacción se transcribe en el surco principal del dímero del bucle de besos. [8]

El virus de la inmunodeficiencia humana ( VIH ) es un retrovirus que puede transmitirse a través de las interacciones de los fluidos corporales. Hay dos tipos de virus del VIH, el virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1 ( VIH-1 ) y el virus de la inmunodeficiencia humana tipo 2 ( VIH-2). De los dos tipos de cepa del virus de la inmunodeficiencia humana, el VIH-1 es la cepa más común. El ARN del virus VIH-1 utiliza la interacción del lazo del tallo besante como medio de reconocimiento, el paso principal de interacción del sitio de inicio de dimerización (DIS) para formar el dúplex. Para estudiar la interacción del bucle del tallo del beso, se observó que el complejo del sitio de iniciación de dimerización (DIS) era esencial para la replicación del virus del VIH tipo 1 en la célula eucariota, y cualquier cambio en la estructura del bucle del tallo disminuyó la interacción de dimerización. . Experimentalmente, se ha visto que, in vivo, la mutación del sitio de inicio de dimerización (DIS) obstruía la dimerización del complejo DIS. [9]


Un ejemplo de un tallo-bucle de ARN. Si ahora un segundo vástago-bucle de ARN tiene una secuencia de bases complementaria, los dos bucles pueden formar pares de bases dando como resultado un bucle de besos.
Este GIF animado muestra dos bucles de ARN (naranja y verde) unidos entre sí en una estructura llamada bucle de besos. Los dos bucles de ARN interactúan mediante interacciones de apilamiento y mediante enlaces de hidrógeno (las bases que interactúan se muestran en la representación que llena el espacio). [1]