El índice de Lindemann [1] es una medida simple del desorden impulsado térmicamente en átomos o moléculas. El índice de Lindemann local se define como: [2]
donde los paréntesis angulares indican un promedio de tiempo. El índice de Lindemann global es un promedio del sistema de esta cantidad.
- En física de la materia condensada
- una desviación de linealidad en el comportamiento del índice Lindemann global o un aumento por encima de un valor de umbral relacionado con la separación entre los átomos (o micelas , partículas, glóbulos, etc.) a menudo se toma como la indicación de que un sólido-líquido de transición de fase tiene lugar tomado. Consulte el criterio de fusión de Lindemann .
- Biomoléculas
- a menudo poseen regiones separadas con diferentes características de orden. Para cuantificar o ilustrar el trastorno local, se puede utilizar el índice de Lindemann local. [3]
Se debe tener cuidado si la molécula posee una dinámica definida globalmente, como alrededor de una bisagra o pivote, porque estos movimientos oscurecerán los movimientos locales que el índice de Lindemann está diseñado para cuantificar. Una táctica apropiada en esta circunstancia es sumar r ij solo sobre un pequeño número de átomos vecinos para llegar a cada q i . Se dispone de una variedad adicional de tales modificaciones al índice de Lindemann y tienen diferentes ventajas, por ejemplo, para el estudio de materiales vítreos frente a cristalinos . [4]
Referencias
- ^ Lindemann FA (1910). "El cálculo de las frecuencias de vibración molecular". Phys. Z . 11 : 609–612.
- ^ Zhang K, Stocks GM, Zhong J (2007). "Fusión y prefusión de nanotubos de carbono". Nanotecnología . 18 (285703): 285703. doi : 10.1088 / 0957-4484 / 18/28/285703 .
- ^ Rueda M, Ferrer-Costa C, Meyer T, Pérez A, Camps J, Hospital A, Gelpi JL, Orozco M (2007-01-16). "Una visión de consenso de la dinámica de las proteínas" . PNAS . 104 (3): 796–801. doi : 10.1073 / pnas.0605534104 . PMC 1783393 . PMID 17215349 .
- ^ Zhou Y, Karplus M, Ball KD, Berry RS (2002). "El criterio de fluctuación de distancia para la fusión: comparación de modelos de potencial de pozos cuadrados y Morse para clusters y homopolímeros". J. Chem. Phys . 116 (5): 2323. doi : 10.1063 / 1.1426419 .