Registro MIRIAM


El Registro MIRIAM , un subproducto de las Directrices MIRIAM , es una base de datos de espacios de nombres e información asociada que se utiliza en la creación de identificadores uniformes de recursos . Contiene el conjunto de espacios de nombres aprobados por la comunidad para bases de datos y recursos que sirven, principalmente, al dominio de las ciencias biológicas. Estos espacios de nombres compartidos, cuando se combinan con identificadores de 'recopilación de datos', se pueden usar para crear identificadores únicos a nivel mundial para el conocimiento almacenado en los repositorios de datos. Para obtener más información sobre el uso de URI para anotar modelos, consulte la especificación de SBML Nivel 2 Versión 2 (y superior).

Una 'recopilación de datos' se define como un conjunto de datos que genera un proveedor. Un 'recurso' se define como un distribuidor de esos datos. Tal descripción permite asociar numerosos recursos con una sola colección, lo que permite una representación precisa de cómo la información biológica está disponible en la World Wide Web; a menudo, la misma información, de una sola recopilación de datos, puede ser reflejada por diferentes recursos, o la información central puede complementarse con otros datos.

El Registro MIRIAM es un recurso curado, que está disponible gratuitamente y abierto a todos. Las presentaciones para nuevas colecciones se pueden hacer a través del sitio web. [1]

Las Directrices MIRIAM exigen el uso de identificadores de recursos uniformes en la anotación de los componentes del modelo. Estos se crean usando la lista compartida de espacios de nombres definidos en el Registro MIRIAM.

Utilizando los espacios de nombres definidos en el Registro MIRIAM, es posible crear identificadores tanto en forma de URN como de URL. Esto requiere un identificador único específico de la colección, así como un espacio de nombres para restringir globalmente el espacio de información. Tanto el espacio de nombres como la raíz de cada formulario de URI se proporcionan para cada recopilación de datos en el Registro. Ambas formas se derivan del mismo espacio de nombres. Por ejemplo:

La forma URN de identificadores requiere el uso de servicios web o medios programáticos para acceder al registro al que se hace referencia. Esto significa que uno no puede simplemente poner el formulario URN en una ventana del navegador y llegar a la información a la que se hace referencia. El formulario de URL se puede resolver directamente y se basa en una capa de resolución proporcionada por Identifiers.org .


Ejemplo de una entrada almacenada en el Registro MIRIAM