Maqsudul Alam (14 de diciembre de 1954 - 20 de diciembre de 2014) fue un científico de ciencias biológicas nacido en Bangladesh [1] [2] que es conocido por su trabajo en la secuenciación del genoma . Su trabajo sobre la secuenciación del genoma comenzó con la bacteria Idiomarina loihiensis en 2003. [3] Se convirtió en el centro de atención del pueblo de Bangladesh después de su trabajo sobre la secuenciación del genoma del yute tosha ( Corchorus olitorius O4) en 2010, [4] yute blanco ( Corchorus capsularis CVL1 ) en 2013 [5] y el hongo que ataca el yute ( Macrophomina phaseolina ) en 2012. [6]
Maqsudul Alam | |
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Nació | |
Fallecido | 20 de diciembre de 2014 Hawaii , Estados Unidos | (60 años)
Lugar de descanso | Parque General de Hawái , EE. UU. |
Nacionalidad | Bangladesí-americano |
alma mater | Universidad Estatal de Moscú Instituto Max Planck de Bioquímica |
Conocido por | Secuenciación del genoma de papaya, caucho y yute |
Carrera científica | |
Instituciones | Universidad de Hawaii en Manoa |
Alam también trabajó en la secuenciación del genoma de papaya transgénica ( Carica papaya Linnaeus) en 2007, [7] árbol de caucho ( Hevea brasiliensis ) en 2009, [8] bacteria Methylacidiphilum infernorum en 2007, [9] Methylocella silvestris BL2 en 2009, [10] Saprospira grandis str. Lewin en 2011, [11] Geobacillus thermoleovorans CCB_US3_UF5 en 2011, [12] Thermus sp. cepa CCB_US3_UF1 en 2011, [13] [14] Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Typhi P-stx-12 en 2011, [15] Thermomyces lanuginosus Cepa SSBP [16] y Pantoea anthophila en 2014. [17]
Vida temprana
Alam nació en Madaripur , Faridpur , Pakistán Oriental. Sus padres fueron Dalil Uddin Ahmed, mártir de la Guerra de Liberación de 1971 y funcionario de East Pakistan Rifles; y Lyrian Ahmed, maestra y trabajadora social. [1]
Vida personal
Alam se casó con Irina Anatolievna durante su estancia en Rusia. Alam era estudiante de doctorado y Anatolievna era estudiante de medicina en ese momento. La pareja tuvo una hija llamada Liliana Maqsudulovna Alam (1986-2019). [18] En 1992, la familia se mudó a Estados Unidos. La pareja se divorció en 1997 [19].
Alam luego se casó con Rafia Hasina en 2009.
Educación
Alam completó la educación secundaria y secundaria superior de Government Laboratory High School y Dhaka College , respectivamente. Completó su Maestría en Microbiología de la Universidad Estatal de Moscú en 1979; y obtuvo su primer doctorado en Microbiología de la misma universidad en 1982. Obtuvo su segundo doctorado en Bioquímica del Instituto Max Planck de Bioquímica en 1987. [1] [2]
Carrera académica
De 1988 a 1990, Alam fue investigador científico senior en el Instituto de Química Bioorgánica de la Academia de Ciencias de Rusia. Luego, fue científico invitado del departamento de Bioquímica y Biofísica de la Universidad Estatal de Washington de 1990 a 1992. Alam fue subdirector del Centro de Ingeniería de Bioproductos Marinos (MarBEC) en la Universidad de Hawaii.
En 1992, Alam se incorporó al departamento de Microbiología de la Universidad de Hawaii, Manoa, como profesor asistente. En 1997 fue ascendido a profesor asociado. Alam se convirtió en profesor titular en 2001, cargo que ocupó hasta su muerte. También fue Director de Estudios Avanzados en Genómica, Proteómica y Bioinformática en la Universidad de Hawaii, Manoa desde 2003 hasta su muerte. [1] [2]
Alam fue director del Centro de Biología Química de la Universiti Sains Malaysia de 2009 a 2012. [2] En 2011, Alam se convirtió en miembro del consejo asesor de la Universidad de Ciencia y Tecnología de Shahjalal (SUST), Sylhet.
Carrera científica
En 2003, Alam estableció los Estudios Avanzados en Genómica, Proteómica y Bioinformática (ASGPB) en la Universidad de Hawaii en Manoa . Consolidando el marco de secuenciación de ADN de ASGPB con los activos bioinformáticos en el Centro de Computación de Alto Rendimiento de Maui (MHPCC), dirigió un programa de Proteómica Computacional que iba desde la investigación en laboratorio húmedo hasta la informática in silico . [2] Alam y su equipo completaron la secuenciación del genoma de Idiomarina loihiensis , [3] un organismo antiguo encontrado en las fuentes hidrotermales de Loihi durante una expedición de la Universidad de Hawai en 2003. [20]
En 2007, Alam trabajó en el Proyecto del Genoma de la Papaya de Hawaii, cuyo objetivo era secuenciar el genoma completo de la papaya transgénica 'SunUp' . La papaya SunUp fue modificada genéticamente para conferir resistencia al virus de la mancha anular de la papaya , pero los agricultores hawaianos no pudieron vender la papaya transgénica en Japón; Alam y su equipo secuenciaron la papaya transgénica para ayudar a los agricultores a superar el proceso regulatorio. [7] [21]
Alam estableció el Centro de Biología Química en la Universiti Sains Malaysia en 2009. Allí estableció instalaciones de investigación, programas de investigación y trabajó en la secuenciación del genoma del árbol del caucho ( Hevea brasiliensis ). [8]
Proyecto del genoma del yute de Bangladesh
En 2009, Alam se unió al Proyecto de Investigación Básica y Aplicada sobre el yute del Instituto de Investigación del Yute, Bangladesh, como investigador principal. Esperaba que la secuenciación del genoma de un cultivo comercial como el yute ayudaría económicamente a Bangladesh porque el yute puede volverse resistente a las enfermedades si se conoce la secuencia del genoma. El equipo de Alam trabajó en la secuenciación del genoma del yute tossa ( Corchorus olitorius O4) [4] y en 2010, la Primera Ministra Sheikh Hasina anunció públicamente que se había decodificado el genoma del yute y que se presentarían varias solicitudes de patente. [22] [23] El equipo de Alam continuó trabajando en la secuenciación de un hongo que ataca el yute ( Macrophomina phaseolina ) [6] en 2012 y el yute blanco ( Corchorus capsularis CVL1) [5] en 2013. [1]
Muerte
El 20 de diciembre de 2014, Alam murió en el centro médico de Queen, Honolulu, Hawaii. Sufría de cirrosis del hígado. El 23 de diciembre de 2014 fue enterrado en el cementerio Hawaii Memorial Park según su deseo. [24] [25]
Premios
Alam recibió el premio a la excelencia en investigación de la Universidad de Hawaii en 2001, el premio NIH Shannon en 1997, el investigador Humboldt en 1987 de la Fundación de Ciencias Alemanas. [1] En 2016, Alam recibió póstumamente el Premio del Día de la Independencia por parte del Gobierno de Bangladesh . [26]
El "Fondo del Premio de Investigación para Graduados Maqsudul Alam" fue creado por la Fundación de la Universidad de Hawaii para apoyar la educación de estudiantes graduados y honrar a Alam. [2]
Publicaciones
Capítulos de libros
- Synteny and Collinearity in Plant Genomes (2008). [27]
- Sensores de protoglobina y globina acoplados (2008). [28]
Referencias
- ^ a b c d e f "Acerca del profesor Maqsudul Alam" . Proyecto de investigación básica y aplicada sobre el yute (BARJ), Bangladesh .
- ^ a b c d e f "FONDO DE PREMIO DE INVESTIGACIÓN DE GRADUADO MAQSUDUL ALAM" . FUNDACIÓN UNIVERSIDAD DE HAWAI'I .
- ^ a b Hou, Shaobin; Saw, Jimmy H .; Lee, Kit Shan; Freitas, Tracey A .; Belisle, Claude; Kawarabayasi, Yutaka; Donachie, Stuart P .; Pikina, Alla; Galperin, Michael Y. (28 de diciembre de 2004). "La secuencia del genoma de la γ-proteobacterium Idiomarina loihiensis revela la fermentación de aminoácidos como fuente de carbono y energía" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 101 (52): 18036–18041. Código bibliográfico : 2004PNAS..10118036H . doi : 10.1073 / pnas.0407638102 . PMC 539801 . PMID 15596722 .
- ^ a b "Descodificación del genoma del yute" . The Daily Star . 17 de junio de 2010.
- ^ a b "Maqsudul Alam declara la secuencia del genoma de Deshi Jute" . Noticias de Somoy TV .
- ^ a b Islam, Md Shahidul; Haque, Md Samiul; Islam, Mohammad Moinul; Emdad, Emdadul Mannan; Halim, Abdul; Hossen, Quazi Md Mosaddeque; Hossain, Md Zakir; Ahmed, Borhan; Rahim, Sifatur (19 de septiembre de 2012). "Herramientas para matar: Genoma de uno de los hongos fitopatógenos más destructivos Macrophomina phaseolina" . BMC Genomics . 13 (1): 493. doi : 10.1186 / 1471-2164-13-493 . ISSN 1471-2164 . PMC 3477038 . PMID 22992219 .
- ^ a b Ming, Ray; Hou, Shaobin; Feng, Yun; Yu, Qingyi; Dionne-Laporte, Alexandre; Saw, Jimmy H .; Senin, Pavel; Wang, Wei; Ly, Benjamin V. (abril de 2008). "El proyecto de genoma de la papaya de árbol de frutas tropicales transgénicas (Carica papaya Linnaeus)" . Naturaleza . 452 (7190): 991–996. Código Bibliográfico : 2008Natur.452..991M . doi : 10.1038 / nature06856 . ISSN 0028-0836 . PMC 2836516 . PMID 18432245 .
- ^ a b Rahman, Ahmad Yamin Abdul; Usharraj, Abhilash O .; Misra, Biswapriya B .; Thottathil, Gincy P .; Jayasekaran, Kandakumar; Feng, Yun; Hou, Shaobin; Ong, Su Yean; Ng, Fui Ling (2 de febrero de 2013). "Proyecto de secuencia del genoma del árbol de caucho Hevea brasiliensis" . BMC Genomics . 14 (1): 75. doi : 10.1186 / 1471-2164-14-75 . ISSN 1471-2164 . PMC 3575267 . PMID 23375136 .
- ^ Hou, Shaobin; Makarova, Kira S .; Saw, Jimmy HW; Senin, Pavel; Ly, Benjamin V .; Zhou, Zhemin; Ren, Yan; Wang, Jianmei; Galperin, Michael Y. (1 de julio de 2008). "Secuencia completa del genoma del aislado metanótrofo extremadamente acidófilo V4, Methylacidiphilum infernorum, un representante del filo bacteriano Verrucomicrobia" . Biology Direct . 3 (1): 26. doi : 10.1186 / 1745-6150-3-26 . ISSN 1745-6150 . PMC 2474590 . PMID 18593465 .
- ^ Chen, Yin; Crombie, Andrew; Rahman, M. Tanvir; Dedysh, Svetlana N .; Liesack, Werner; Stott, Matthew B .; Alam, Maqsudul; Theisen, Andreas R .; Murrell, J. Colin (15 de julio de 2010). "Secuencia completa del genoma del metanótrofo facultativo aeróbico Methylocella silvestris BL2" . Revista de bacteriología . 192 (14): 3840–3841. doi : 10.1128 / JB.00506-10 . ISSN 0021-9193 . PMC 2897342 . PMID 20472789 .
- ^ Saw, Jimmy HW; Yuryev, Anton; Kanbe, Masaomi; Hou, Shaobin; Young, Aaron G .; Aizawa, Shin-Ichi; Alam, Maqsudul (19 de marzo de 2012). "Secuenciación completa del genoma y análisis de Saprospira grandis str. Lewin, una bacteria marina depredadora" . Estándares en Ciencias Genómicas . 6 (1): 84–93. doi : 10.4056 / sigs.2445005 . ISSN 1944-3277 . PMC 3368406 . PMID 22675601 .
- ^ Sakaff, Muhd Khairul Luqman Muhd; Rahman, Ahmad Yamin Abdul; Saito, Jennifer A .; Hou, Shaobin; Alam, Maqsudul (1 de marzo de 2012). "Secuencia completa del genoma de la bacteria termófila Geobacillus thermoleovorans CCB_US3_UF5" . Revista de bacteriología . 194 (5): 1239. doi : 10.1128 / JB.06580-11 . ISSN 0021-9193 . PMC 3294819 . PMID 22328744 .
- ^ Teh, Beng Soon; Rahman, Ahmad Yamin Abdul; Saito, Jennifer A .; Hou, Shaobin; Alam, Maqsudul (1 de marzo de 2012). "Secuencia completa del genoma de la bacteria termófila Thermus sp. Cepa CCB_US3_UF1" . Revista de bacteriología . 194 (5): 1240. doi : 10.1128 / JB.06589-11 . ISSN 0021-9193 . PMC 3294796 . PMID 22328745 .
- ^ Teh, Beng Soon; Lau, Nyok-Sean; Ng, Fui Ling; Abdul Rahman, Ahmad Yamin; Wan, Xuehua; Saito, Jennifer A .; Hou, Shaobin; Teh, Aik-Hong; Najimudin, Nazalan (8 de octubre de 2015). "Secuencia completa del genoma del termófilo Thermus sp. CCB_US3_UF1 de una fuente termal en Malasia" . Estándares en Ciencias Genómicas . 10 (1): 76. doi : 10.1186 / s40793-015-0053-6 . ISSN 1944-3277 . PMC 4599208 . PMID 26457128 .
- ^ Ong, Su Yean; Pratap, Chandra Bhan; Wan, Xuehua; Hou, Shaobin; Rahman, Ahmad Yamin Abdul; Saito, Jennifer A .; Nath, Gopal; Alam, Maqsudul (15 de abril de 2012). "Secuencia completa del genoma de Salmonella enterica subsp. Enterica Serovar Typhi P-stx-12" . Revista de bacteriología . 194 (8): 2115–2116. doi : 10.1128 / JB.00121-12 . ISSN 0021-9193 . PMC 3318496 . PMID 22461552 .
- ^ Mchunu, Nokuthula Peace; Permaul, Kugen; Rahman, Ahmad Yamin Abdul; Saito, Jennifer A .; Singh, Suren; Alam, Maqsudul (27 de junio de 2013). "Superproductor de xilanasa: secuencia del genoma de un hongo termófilo amante del abono, cepa SSBP de Thermomyces lanuginosus" . Anuncios del genoma . 1 (3): e00388–13. doi : 10.1128 / genomeA.00388-13 . ISSN 2169-8287 . PMC 3707600 . PMID 23788551 .
- ^ Wan, Xuehua; Hou, Shaobin; Phan, Nolwenn; Moss, Jennifer S. Malone; Donachie, Stuart P .; Alam, Maqsudul (25 de junio de 2015). "Proyecto de secuencia del genoma de la cepa 11-2 de Pantoea anthophila de Hypersaline Lake Laysan, Hawaii" . Anuncios del genoma . 3 (3): e00321–15. doi : 10.1128 / genomeA.00321-15 . ISSN 2169-8287 . PMC 4432323 . PMID 25977417 .
- ^ Weilenman, Donna Beth (19 de junio de 2019). "Mujer que caminaba sobre el ferrocarril golpeada, asesinada por un tren" . Martinez News-Gazette .
- ^ "Biografía-Liliana" . Sitios de Google .
- ^ "El pequeño equipo de genes UH logra una gran hazaña" . Boletín estrella . 2003.
- ^ Borrell, Brendan (23 de abril de 2008). "Proyecto del genoma de la papaya da sus frutos" . Naturaleza . doi : 10.1038 / news.2008.772 . ISSN 0028-0836 .
- ^ "Secuencia del genoma del yute revelada" . Liga Awami de Bangladesh .
- ^ "Secuencia del genoma del yute decodificada por científicos de Bangladesh" . Tiempos del Hindustan .
- ^ "Fallece el científico Maqsudul Alam" . Prothom-Alo . 21 de diciembre de 2014.
- ^ "Fallece el decodificador del genoma de yute Maqsudul Alam" . Estrella diaria . 20 de diciembre de 2014 . Consultado el 21 de diciembre de 2014 .
- ^ "Premio Día de la Independencia" (PDF) . Gobierno de Bangladesh . Consultado el 23 de septiembre de 2016 .
- ^ Tang, Haibao; Bowers, John E .; Wang, Xiyin; Ming, Ray; Alam, Maqsudul; Paterson, Andrew H. (25 de abril de 2008). "Sintencia y colinealidad en genomas vegetales". Ciencia . 320 (5875): 486–488. Código Bibliográfico : 2008Sci ... 320..486T . doi : 10.1126 / science.1153917 . ISSN 0036-8075 . PMID 18436778 . S2CID 206510918 .
- ^ Freitas, Tracey Allen K .; Saito, Jennifer A .; Wan, Xuehua; Hou, Shaobin; Alam, Maqsudul (2008), "Sensores acoplados a protoglobina y globina", Las biomoléculas más pequeñas: diatómicas y sus interacciones con las proteínas hem , Elsevier, págs. 175-202, doi : 10.1016 / b978-044452839-1.50008-5 , ISBN 9780444528391