La estación fue construida originalmente el 23 de febrero de 1888 por Chicago, Burlington and Quincy Railroad , como reemplazo del antiguo Union Depot que se construyó en 1853 y se incendió en 1885. Originalmente contenía un hotel, restaurantes y salas de espera para pasajeros y habitaciones para los empleados del ferrocarril. En 1942, gran parte de la estación fue demolida, quedando intactos poco más que la sala de espera y la taquilla.
Hoy en día, el edificio es propiedad y está conservado por el Museo y Sociedad Histórica de Mendota como el Museo del Ferrocarril Union Depot . [4] La estación es una parada regular para el Illinois Zephyr y el Southwest Chief . El California Zephyr también usa estas pistas, pero no se detiene en Mendota. BNSF Railway también tiene un pequeño patio de carga y una oficina adyacente a la estación. Este patio se utiliza para almacenar trenes y locomotoras que realizan recorridos locales a lo largo de la Subdivisión Mendota (que generalmente son arrastrados por conmutadores de carreteras de cuatro ejes).