Hay siete isótopos estables de mercurio ( 80 Hg), siendo 202 Hg el más abundante (29,86%). Los radioisótopos de vida más larga son 194 Hg con una vida media de 444 años y 203 Hg con una vida media de 46,612 días. La mayoría de los 40 radioisótopos restantes tienen vidas medias inferiores a un día. 199 Hg y 201 Hg son los núcleos activos por RMN más estudiados , con números cuánticos de espín de 1/2 y 3/2 respectivamente.
En 2010 se descubrió que 180 Hg, producibles a partir de 180 Tl , eran capaces de una forma inusual de fisión espontánea . [3] Los productos de fisión son 80 Kr y 100 Ru .