Informática del genoma del ratón


Mouse Genome Informatics ( MGI ) es una base de datos en línea gratuita y un recurso de bioinformática alojado por The Jackson Laboratory , con financiamiento del Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano (NHGRI), el Instituto Nacional del Cáncer (NCI) y el Instituto Nacional de Investigación Eunice Kennedy Shriver. Salud Infantil y Desarrollo Humano (NICHD). [1] MGI brinda acceso a datos sobre la genética, la genómica y la biología del ratón de laboratorio para facilitar el estudio de la salud y las enfermedades humanas. [2] [3]La base de datos integra múltiples proyectos, con las dos mayores contribuciones provenientes de la base de datos del genoma del ratón y la base de datos de la expresión génica del ratón (GXD). [4] A partir de 2018 , MGI contiene datos seleccionados de más de 230 000 publicaciones. [5]

El recurso MGI se publicó por primera vez en línea en 1994 [5] y es una colección de datos, herramientas y análisis creados y adaptados para su uso en ratones de laboratorio , un organismo modelo ampliamente utilizado . Es "la fuente autorizada de nombres oficiales para genes, alelos y cepas de ratones", que siguen las pautas establecidas por el Comité Internacional de Nomenclatura Genética Estandarizada para Ratones. [6]La historia y el enfoque de las instalaciones de investigación y producción del Laboratorio Jackson generan un conocimiento y una profundidad tremendos que los investigadores pueden aprovechar para avanzar en sus investigaciones. Una comunidad dedicada de investigadores de ratones en todo el mundo mejora y contribuye al conocimiento también. Esta es una herramienta indispensable para cualquier investigador que utilice el ratón como organismo modelo para su investigación, y para los investigadores interesados ​​en genes que comparten homología con los genes del ratón. Varios recursos de apoyo a la investigación con ratones, incluidas colecciones de animales y software gratuito de gestión de colonias, también están disponibles en el sitio de MGI. [7]

La base de datos del genoma del ratón recopila y selecciona anotaciones fenotípicas y funcionales integrales para genes y alelos de ratón . [8] Este es un proyecto financiado por NHGRI que contribuye a la base de datos de Mouse Genome Informatics.

La base de datos de expresión génica es un recurso comunitario de información sobre la expresión del desarrollo del ratón. [9]