Los dominios PAN tienen una versatilidad funcional significativa que cumple diversas funciones biológicas al mediar en las interacciones proteína-proteína y proteína-carbohidrato . [1] Estos dominios contienen una estructura similar a un lazo de horquilla , similar a la que se encuentra en las knottins pero con un patrón diferente de enlaces disulfuro .
Se ha demostrado que los dominios N-terminales de miembros de la familia del factor de crecimiento plasminógeno / hepatocito , los dominios de manzana de la familia del factor XI de precalicreína / coagulación plasmática y los dominios de varias proteínas de nematodos pertenecen a la misma superfamilia de módulos, el módulo PAN . [1] El dominio PAN contiene un núcleo conservado de tres puentes disulfuro. En algunos miembros de la familia hay un cuarto puente disulfuro adicional que une los extremos N y C del dominio.
El dominio de la manzana, así como otros ejemplos del dominio PAN, consta de 7 hebras β que se pliegan en una hoja antiparalela curva que sostiene una hélice α . Dos enlaces disulfuro bloquean la hélice en las hebras centrales β4 y β5, mientras que un tercero conecta los extremos N y C del dominio. En el dominio de la manzana, el bucle β4-β5 y el bucle cruzado β5-β6 generan un pequeño bolsillo en el lado opuesto de la hoja desde la hélice α. [2]
En el plasminógeno nativo, el dominio PAN está asociado con cinco dominios kringle . [3] Las interacciones entre el dominio PAN y los kringles juegan un papel crítico en la estabilización del complejo cuaternario del plasminógeno nativo;