En enzimología , un protocatecuato 3,4-dioxigenasa ( EC 1.13.11.3 ) es una enzima que cataliza la reacción química.
protocatecuato 3,4-dioxigenasa | ||||||||
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![]() Protocatecuato 3,4-dioxigenasa hetero24mer, Pseudomonas putida | ||||||||
Identificadores | ||||||||
CE no. | 1.13.11.3 | |||||||
No CAS. | 9029-47-4 | |||||||
Bases de datos | ||||||||
IntEnz | Vista IntEnz | |||||||
BRENDA | Entrada BRENDA | |||||||
FÁCIL | NiceZyme vista | |||||||
KEGG | Entrada KEGG | |||||||
MetaCyc | camino metabólico | |||||||
PRIAM | perfil | |||||||
Estructuras PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | |||||||
Ontología de genes | AmiGO / QuickGO | |||||||
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- 3,4-dihidroxibenzoato + O 2 3-carboxi-cis, cis-muconato
Así, los dos sustratos de esta enzima son 3,4-dihidroxibenzoato ( ácido protocatechico ) y O 2 , mientras que su producto es 3-carboxi-cis, cis-muconato .
Esta enzima pertenece a la familia de las oxidorreductasas , concretamente las que actúan sobre donantes únicos con O 2 como oxidante e incorporación de dos átomos de oxígeno al sustrato (oxigenasas). El nombre sistemático de esta clase de enzimas es protocatecuato: oxígeno 3,4-oxidorreductasa (desciclizante) . Otros nombres de uso común incluyen protocatecuato oxigenasa , ácido protocatecuico oxidasa , protocatechuica 3,4-dioxigenasa y protocatecuato 3,4-oxigenasa . Esta enzima participa en la degradación del benzoato a través de la hidroxilación y la degradación del 2,4-diclorobenzoato . Emplea un cofactor , el hierro .
Se ha descubierto que esta enzima es eficaz para mejorar la estabilidad de los fluoróforos orgánicos en experimentos de molécula única. [1] Preparaciones comerciales de la enzima aislada de Pseudomonas spp. generalmente requieren una purificación adicional para eliminar una fuerte actividad nucleasa contaminante.
Estudios estructurales
A finales de 2007, se han resuelto 37 estructuras para esta clase de enzimas, con códigos de acceso PDB 1EO2 , 1EO9 , 1EOA , 1EOB , 1EOC , 1YKK , 1YKL , 1YKM , 1YKN , 1YKO , 1YKP , 2BUM , 2BUQ , 2BUR , 2BUT , 2BUU , 2BUV , 2BUW , 2BUX , 2BUY , 2BUZ , 2BV0 , 2PCD , 3PCA , 3PCB , 3PCC , 3PCD , 3PCE , 3PCF , 3PCG , 3PCH , 3PCI , 3PCJ , 3PCK , 3PCL , 3PCM y 3PCN .
Ver también
- Ácido protocatechico
Referencias
- ^ Aitken CE, Marshall RA, Puglisi JD (2008). "Un sistema de barrido de oxígeno para mejorar la estabilidad del tinte en experimentos de fluorescencia de una sola molécula" . Biophys. J . 94 (5): 1826–1835. Código bibliográfico : 2008BpJ .... 94.1826A . doi : 10.1529 / biophysj.107.117689 . PMC 2242739 . PMID 17921203 .
- Fujisawa H, Hayaishi O (1968). "Protocatecuato 3,4-dioxigenasa. I. Cristalización y caracterización". J. Biol. Chem . 243 (10): 2673–81. PMID 4967959 .
- GROSS SR, GAFFORD RD, TATUM EL (1956). "El metabolismo del ácido protocatechico por Neurospora". J. Biol. Chem . 219 (2): 781–96. PMID 13319299 .
- Stanier RY, Ingraham JL (1954). "Acido protocatechico oxidasa". J. Biol. Chem . 210 (2): 799–820. PMID 13211618 .