Ran ( RA relacionados s- N uclear proteína) también conocido como unión GTP-Ran proteína nuclear es una proteína que en los humanos está codificada por el RAN gen . Ran es una pequeña proteína de 25 kDa que participa en el transporte dentro y fuera del núcleo celular durante la interfase y también en la mitosis . Es miembro de la superfamilia Ras . [5] [6] [7]
CORRIÓ |
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Estructuras disponibles |
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PDB | Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB |
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Lista de códigos de identificación de PDB |
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1I2M , 1IBR , 1K5D , 1K5G , 1QBK , 1RRP , 2MMC , 2MMG , 3CH5 , 3EA5 , 3GJ0 , 3GJ3 , 3GJ4 , 3GJ5 , 3GJ6 , 3GJ7 , 3GJ8 , 3GJX , 3NBY , 3NBZ , 3NC0 , 3NC1 , 3ZJY , 4C0Q , 4GMX , 4GPT , 4 SOMBRERO, 4HAU , 4HAV , 4HAW , 4HAX , 4HAY , 4HAZ , 4HB0 , 4HB2 , 4HB3 , 4HB4 , 4OL0 , 4WVF , 5CIQ , 5CIT , 5CIW , 5CJ2 , 5CLL , 5CLQ , 5DH9 , 5DHA , 5DHF , 5DI9 , 5DIF , 3A6P , 1A2K , 5DIS , 5BXQ , 5DLQ , 5FYQ , 2N1B , 5JLJ |
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Identificadores |
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Alias | RAN , ARA24, Gsp1, TC4, Ran, miembro de la familia de oncogenes RAS |
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Identificaciones externas | OMIM : 601179 MGI : 1333112 HomoloGene : 68143 GeneCards : RAN |
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Ubicación de genes ( humanos ) |
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| Chr. | Cromosoma 12 (humano) [1] |
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| Banda | 12q24.33 | Comienzo | 130.872.037 pb [1] |
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Final | 130.877.678 pb [1] |
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Ubicación de genes ( ratón ) |
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| Chr. | Cromosoma 5 (ratón) [2] |
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| Banda | 5 | 5 G1.3 | Comienzo | 129.020.069 pb [2] |
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Final | 129.024.323 pb [2] |
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Patrón de expresión de ARN |
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| Más datos de expresión de referencia |
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Ontología de genes |
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Función molecular | • unión de nucleótidos • GO: 0001105 actividad coactivadora de la transcripción • unión de pre-miRNA • unión de cromatina • GO: unión de proteínas 0001948 • unión de receptor de andrógenos • GO: 0006184 actividad de GTPasa • unión de GTP • unión de ARN • unión de cadherina • unión de iones de magnesio • GO: 0005487 constituyente estructural de poro nuclear • unión PIB • actividad heterodimerización proteína • señal de exportación nuclear actividad del receptor • unión de iones metálicos • unión específica de proteínas de dominio • GO: 0032403 complejo de unión que contiene proteína • dineína cadena intermedia de unión • proteína de la familia importin-alfa de unión
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Componente celular | • reciclaje endosoma • citosol • Flemming cuerpo • melanosomas • nucleoplasma • cuerpo central • complejo de exportación de ARN nuclear • nucleolo • centriolo • cromatina • extracelular exosome • membrana • citoplasma • núcleo • GO: 0005578 matriz extracelular • poro nuclear • célula huésped • envoltura nuclear • complejo que contiene proteínas • núcleo de células germinales masculinas • manchette • flagelo de esperma
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Proceso biológico | • Exportación de subunidades pequeñas ribosómicas desde el núcleo • GO: 0046795 transporte intracelular de virus • Vía de señalización del receptor de andrógenos • Localización de proteínas en el nucleolo • GO: 0043148 Organización del huso mitótico • Proceso metabólico del ADN • Exportación de pre-miARN desde el núcleo • División celular • Regulación positiva de transcripción, plantilla de ADN • Transporte nucleocitoplasmático • Exportación de proteínas desde el núcleo • Transporte de proteínas • Exportación de subunidades grandes ribosómicas desde el núcleo • Ciclo celular • Regulación positiva de la unión a proteínas • GO: 0022415 proceso viral • Exportación de tRNA desde el núcleo • GO: 0007067 ciclo celular mitótico • Importación de proteínas al núcleo • Proceso metabólico de miARN • Regulación del proceso biosintético del colesterol • Regulación del silenciamiento de genes por miARN • Transporte • Segregación mitótica de cromátidas hermanas • Proceso metabólico de GTP • Importación de ARNn al núcleo • Regulación positiva de la importación de proteínas al núcleo • Desarrollo de espermátidas • respuesta a compuestos cíclicos orgánicos • desarrollo del hipocampo • cit de actina organización oskeleton • localización de la proteína celular • localización celular complejo que contiene la proteína- • regulación de la proteína de unión • respuesta celular al estímulo de mineralocorticoides
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Fuentes: Amigo / QuickGO |
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Ortólogos |
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Especies | Humano | Ratón |
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Entrez | | |
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Ensembl | | |
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UniProt | | |
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RefSeq (ARNm) | |
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NM_006325 NM_001300796 NM_001300797 |
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RefSeq (proteína) | |
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NP_001287725 NP_001287726 NP_006316 |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 12: 130,87 - 130,88 Mb | Crónicas 5: 129,02 - 129,02 Mb |
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Búsqueda en PubMed | [3] | [4] |
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Wikidata |
Ver / editar humano | Ver / Editar mouse |
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Ran es una pequeña proteína G que es esencial para la translocación de ARN y proteínas a través del complejo de poros nucleares . La proteína Ran también se ha implicado en el control de la síntesis de ADN y la progresión del ciclo celular, ya que se ha descubierto que las mutaciones en Ran interrumpen la síntesis de ADN. [8]
Ciclo de ran
Representación esquemática del ciclo de Ran
Ran existe en la célula en dos formas unidas a nucleótidos: unidas a GDP y a GTP . RanGDP se convierte en RanGTP mediante la acción de RCC1 , el factor de intercambio de nucleótidos de Ran. RCC1 también se conoce como RanGEF (factor de intercambio de nucleótidos de guanina Ran). La actividad intrínseca de Ran GTPasa se activa mediante la interacción con la proteína activadora de Ran GTPasa (RanGAP), facilitada por la formación de complejos con la proteína de unión a Ran (RanBP). La activación de GTPasa conduce a la conversión de RanGTP a RanGDP, cerrando así el ciclo de Ran.
Ran puede difundirse libremente dentro de la célula, pero debido a que RCC1 y RanGAP están ubicados en diferentes lugares de la célula, la concentración de RanGTP y RanGDP también difiere localmente, creando gradientes de concentración que actúan como señales para otros procesos celulares. RCC1 está unido a la cromatina y, por lo tanto, se encuentra dentro del núcleo . RanGAP es citoplasmático en la levadura y está unido a la envoltura nuclear en plantas y animales. En células de mamíferos, se modifica con SUMO y se une al lado citoplásmico del complejo de poro nuclear mediante la interacción con la nucleoporina RANBP2 (Nup358). Esta diferencia en la ubicación de las proteínas accesorias en el ciclo de Ran conduce a una alta proporción de RanGTP a RanGDP dentro del núcleo y una proporción de RanGTP a RanGDP inversamente baja fuera del núcleo. Además de un gradiente del estado de unión a nucleótidos de Ran, existe un gradiente de la propia proteína, con una concentración más alta de Ran en el núcleo que en el citoplasma. El RanGDP citoplásmico es importado al núcleo por la pequeña proteína NUTF2 (Factor de transporte nuclear 2), donde RCC1 puede catalizar el intercambio de GDP por GTP en Ran.
Papel en el transporte nuclear durante la interfase
Participación del ciclo de Ran en el transporte nucleocitoplasmático en el poro nuclear
Ran participa en el transporte de proteínas a través de la envoltura nuclear al interactuar con carioferinas y cambiar su capacidad para unirse o liberar moléculas de carga. Las proteínas de carga que contienen una señal de localización nuclear (NLS) son unidas por importinas y transportadas al núcleo. Dentro del núcleo, RanGTP se une a la importación y libera la carga de importación. La carga que necesita salir del núcleo hacia el citoplasma se une a la exportación en un complejo ternario con RanGTP. Tras la hidrólisis de RanGTP a RanGDP fuera del núcleo, el complejo se disocia y se libera la carga de exportación.
Papel en la mitosis
Durante la mitosis, el ciclo de Ran está involucrado en el ensamblaje del huso mitótico y el reensamblaje de la envoltura nuclear después de que los cromosomas se han separado. [9] [10] Durante la profase , el gradiente pronunciado en la relación RanGTP-RanGDP en los poros nucleares se rompe a medida que la envoltura nuclear se vuelve con fugas y se desmonta. La concentración de RanGTP se mantiene alta alrededor de los cromosomas mientras que RCC1, un factor de intercambio de nucleótidos, permanece unido a la cromatina . [11] RanBP2 (Nup358) y RanGAP se mueven a los cinetocoros donde facilitan la unión de las fibras del huso a los cromosomas. Además, RanGTP promueve el ensamblaje del huso mediante mecanismos similares a los mecanismos de transporte nuclear: la actividad de los factores de ensamblaje del huso como NuMA y TPX2 es inhibida por la unión a importinas. Al liberar importinas, RanGTP activa estos factores y, por lo tanto, promueve el ensamblaje del huso mitótico . En la telofase , la hidrólisis de RanGTP y el intercambio de nucleótidos son necesarios para la fusión de vesículas en las envolturas nucleares reformadoras de los núcleos hijos.
Ran y el receptor de andrógenos
RAN es un coactivador del receptor de andrógenos (AR) (ARA24) que se une de manera diferencial con diferentes longitudes de poliglutamina dentro del receptor de andrógenos. La expansión de la repetición de poliglutamina en el AR está relacionada con la atrofia muscular espinal y bulbar (enfermedad de Kennedy). La coactivación de RAN del AR disminuye con la expansión de poliglutamina dentro del AR, y esta coactivación débil puede conducir a una insensibilidad androgénica parcial durante el desarrollo de atrofia muscular espinal y bulbar. [12] [13]
Se ha demostrado que Ran interactúa con:
- KPNB1 , [14] [15] [16]
- NEK9 , [17]
- NUTF2 , [18] [19]
- RANBP1 , [14] [20] [21]
- RANGAP1 , [22] [23] [24]
- RCC1 , [20] [21] [25] [26]
- TNPO1 , [27] [28]
- TNPO2 , [28]
- XPO1 , [14] [29] [30] y
- XPO5 . [31]
La expresión de Ran está reprimida por el microARN miR-10a . [32]