El virus Río Negro es un alfavirus que se aisló por primera vez en Argentina en 1980. [1] [2] El virus primero se denominó Ag80-663, pero se le cambió el nombre a virus Río Negro en 2005. Es un ex miembro delcomplejo de la encefalitis equina venezolana . (VEEC), que son un grupo de alfavirus en las Américas que tienen el potencial de emerger y causar enfermedades. El virus de Río Negro fue reclasificado recientemente como una especie distinta. [3] Los virus estrechamente relacionados incluyen el virus Mucambo y el virus Everglades . [4]
El virus de Río Negro es un virus esférico con envoltura. La partícula completa del virus, llamada virión, sale de la célula huésped brotando y usando una parte de la membrana de la célula huésped como envoltura. En la superficie de la envoltura hay proteínas que se adhieren a los receptores en la superficie de las células. [5] Hay 80 'puntas' incrustadas en la membrana robada, que están dispuestas en una simetría icosaédrica T=4. [6] En total, el virión de Río Negro tiene unos 70 nanómetros (nm) de diámetro con 3 proteínas estructurales que forman la cápside. Hay 2 marcos de lectura abiertos .(ORF) en el genoma. Las proteínas (E1, E2 y C) están codificadas en el ORF C-terminal cerca del extremo 3' mientras que las proteínas no estructurales (nsPs 1-4) están codificadas en el ORF N-terminal del extremo 5'. Las proteínas E1 y E2 se utilizan para formar la base de las protuberancias que interactúan entre la cápside y la membrana.
El virus tiene un genoma de ARN monocatenario (+ssRNA) de sentido positivo que tiene una longitud de 11,5 kilobases. Codifica una ARN polimerasa dependiente de ARN (RdRp). El genoma de Río Negro es un genoma no segmentado, lo que significa que para hacer copias o proteínas, se debe traducir todo el genoma para obtener una parte específica. Estos luego se dividen en proteínas subgenómicas, que codifican las proteínas estructurales. El genoma y el subgenoma tienen extremos 5' y colas de poli(A) . [2]
El principal vector de transmisión para Río Negro son los mosquitos y roedores. Hay siete mosquitos que han demostrado científicamente ser portadores del virus de Río Negro . Las especies con mayor evidencia de infección fueron Culex interfor , Culex quinquefasciatus , Aedes albifasciatus y Culex (Melanoconion) taeniopus. [2]
El virus de Río Negro , como todos los alfavirus, tiene receptores de glicoproteínas, llamadas proteínas E, en su cubierta. [7] que reconocen receptores celulares para realizar la fusión de membranas. [8] En la envoltura viral, hay originalmente dos de estos receptores de glicoproteína, P62 y E1, que forman un dímero. P62 finalmente se escinde en proteínas E2 y E3, formando un trímero, y esto prepara a estas proteínas para que sean reactivas a condiciones ácidas. La fusión de membranas se inicia con el reconocimiento del receptor, seguida de endocitosis mediada por clatrina . Luego, en respuesta al bajo pH del endosoma, se produce un cambio irreversible en la conformación del trímero de glicoproteína. El dominio citoplasmático de la proteína E2 interactúa con la nucleocápside del virus, mientras que su ectodominio se une a los receptores en la superficie de la membrana del huésped. Cuando la proteína E2 se une a los receptores del huésped, el virus es absorbido por el huésped a través de la endocitosis. Una vez que el virus está en un endosoma celular, con pH bajo, las proteínas E1 y E2 se disocian. Este cambio conformacional expone los péptidos de fusión de los virus, que luego fusionan la membrana del virus y el endosoma celular, que transporta la nucleocápside del virus al citoplasma de la célula huésped. [6]