Robert F. Murphy (biólogo computacional)


Robert F. Murphy es profesor de Biología Computacional de Ray and Stephanie Lane y director del Departamento de Biología Computacional de la Universidad Carnegie Mellon , [1] así como profesor de Ciencias Biológicas, Ingeniería Biomédica y Aprendizaje Automático. Fue director fundador (con Jelena Kovacevic [2] ) del Centro de Informática de Bioimagen en Carnegie Mellon. También fundó (con Ivet Bahar ) el Joint CMU-Pitt Ph.D. Programa de Biología Computacional .

Antes de llegar a Carnegie Mellon, Murphy fue becario postdoctoral de la Fundación de Investigación del Cáncer Damon Runyon con el Dr. Charles R. Cantor en la Universidad de Columbia desde 1979 hasta 1983. Murphy obtuvo una licenciatura en bioquímica de Columbia College en 1974 y un doctorado. en Bioquímica del Instituto de Tecnología de California en 1980. Recibió un premio Presidential Young Investigator Award [3] de la National Science Foundation poco después de unirse a la facultad de Carnegie Mellon en 1983. En 2005, NIH lo seleccionó como el primer presidente de término completo de su nueva Sección de Estudios de Análisis y Gestión de Biodatos. [4] En 2006, fue nombrado miembro de laInstituto Americano de Ingeniería Médica y Biológica . [5] En 2019, fue elegido miembro del IEEE por sus contribuciones a los algoritmos de aprendizaje automático para imágenes biológicas. [6] Murphy ha recibido becas de investigación de los Institutos Nacionales de Salud , la Fundación Nacional de Ciencias , la Sociedad Estadounidense del Cáncer , la Asociación Estadounidense del Corazón , la Fundación Artritis y el Fondo Rockefeller Brothers . Ha coeditado dos libros y dos números de revistas especiales sobre “Cell and Molecular Imaging” y ha publicado más de 200 artículos de investigación. [7]Se desempeñó como presidente electo de la Sociedad Internacional para el Avance de la Citometría, [8] fue nombrado como el primer Socio Senior Externo de la Escuela de Ciencias de la Vida en el Instituto de Estudios Avanzados de Friburgo (Alemania) , y ha sido nombrado como un Profesor honorario de la Universidad de Friburgo . Fue miembro del Consejo Asesor Nacional de Ciencias Médicas Generales y del Consejo de Consejos de los Institutos Nacionales de Salud . [9]

La carrera de Murphy se ha centrado en combinar métodos de medición celular basados ​​en fluorescencia con métodos cuantitativos y computacionales. Él y sus colaboradores hicieron un trabajo extenso sobre la aplicación de citometría de flujo para analizar el tráfico de la membrana endocítica a principios de la década de 1980 [10] [11] [12] y fueron pioneros en la aplicación de métodos de aprendizaje automático a imágenes microscópicas de fluorescencia de alta resolución que representan la ubicación subcelular. patrones a mediados de la década de 1990. [13] [14] Este trabajo condujo al desarrollo de los primeros sistemas para reconocer automáticamente todos los patrones principales de orgánulos en imágenes 2D y 3D. [15] [16] [17]Fundó y co-dirige el proyecto CellOrganizer para aprender modelos generativos de organización celular directamente a partir de imágenes microscópicas. También dirige los esfuerzos de análisis y modelado de imágenes para el Centro Nacional de Modelado Multiescala de Sistemas Biológicos.

La experiencia de liderazgo de Murphy incluye el desarrollo del primer programa formal de licenciatura en biología computacional en 1987 y la fundación del programa Merck Computational Biology and Chemistry en Carnegie Mellon en 1999. Estos programas fueron importantes precursores del establecimiento en 2005 del Ph.D. programa en biología computacional en asociación con la Universidad de Pittsburgh . Bajo su liderazgo, este programa fue elegido como uno de los diez premiados por la nueva Iniciativa de Interfaces HHMI-NIBIB. [18]