El Departamento de Biología Computacional (CBD) es una división dentro de la Escuela de Ciencias de la Computación de la Universidad Carnegie Mellon en Pittsburgh , Pensilvania , Estados Unidos . Está ubicado en el Centro Gates-Hillman.
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Tipo | Privado |
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Establecido | 2007 (como Lane Center for Computational Biology) |
Localización | |
Instalaciones | Urbano |
Sitio web | http://www.cbd.cmu.edu/ |
Establecido en 2007 por Robert F. Murphy como el Centro Lane de Biología Computacional con fondos de Raymond J. Lane y Stephanie Lane, [1] CBD se convirtió en un departamento dentro de la Escuela de Ciencias de la Computación en 2016. [2]
Los profesores y estudiantes de CBD llevan a cabo investigaciones en genómica , [3] [4] biología de sistemas , [5] e imágenes biológicas . [6] [7] Su cuerpo docente se ha desempeñado como presidente de la National Science Foundation , [8] presidente de la Sociedad Internacional de Citometría Avanzada, [9] y como miembro del Consejo de Consejos de los Institutos Nacionales de Salud ; [10] han ganado el Premio Overton , [11] el Premio Okawa , [12] un Premio a Joven Investigador de la Fuerza Aérea de los Estados Unidos , [13] y un Premio Presidencial a Joven Investigador . [14]
Como parte de la Iniciativa de Interfaces HHMI-NIBIB, [15] CBD recibió financiación del Instituto Médico Howard Hughes [16] y el Instituto Nacional de Bioingeniería e Imágenes Biomédicas (NIBIB) [17] para desarrollar un doctorado interdisciplinario. programa en biología computacional con la Universidad de Pittsburgh , que fue fundada como Joint CMU-Pitt Ph.D. Programa en Biología Computacional en 2005. [18] Este programa está recibiendo apoyo de capacitación a través de una Beca de Capacitación T32 de los Institutos Nacionales de Salud. [19]
Facultad notable [20]
Reuniones notables organizadas
- RECOMBAR 2014 [21]
- Conferencia de Bioinformática de los Grandes Lagos de 2013 (conjunta con la Universidad de Pittsburgh) [22]
- Análisis automatizado del genoma personal (APGA) 2013 [23]
- Informática de bioimagen 2010 [24]
Programas de grado
- Ph.D. conjunto CMU-Pitt. Programa de Biología Computacional (con la Universidad de Pittsburgh ) [25]
- Maestría en Biología Computacional (conjunta con el Departamento de Ciencias Biológicas) [26]
- Maestría en Innovación Biotecnológica y Computación (en conjunto con el Instituto de Tecnologías del Lenguaje ) [27]
- Licenciatura en Biología Computacional [28]
- Mención en Biología Computacional [29]
Referencias
- ^ (CMU), Universidad Carnegie Mellon. "20 de septiembre: Carnegie Mellon establece el centro Ray y Stephanie Lane de biología computacional - Universidad Carnegie Mellon" . www.cmu.edu . Consultado el 14 de marzo de 2016 .
- ^ (CMU), Universidad Carnegie Mellon. "22 de septiembre: Biología Computacional se convierte en Departamento en la Escuela de Ciencias de la Computación de Carnegie Mellon - Universidad Carnegie Mellon" . www.cmu.edu . Consultado el 14 de marzo de 2016 .
- ^ "El método computacional acelera drásticamente las estimaciones de expresión genética, CMU, informe de investigadores de UMD | Escuela de Ciencias de la Computación Carnegie Mellon" . www.cs.cmu.edu . Consultado el 15 de marzo de 2016 .
- ^ Patro, Rob; Mount, Stephen M .; Kingsford, Carl (1 de mayo de 2014). "Sailfish permite la cuantificación de isoformas sin alineación a partir de lecturas de RNA-seq utilizando algoritmos ligeros" . Biotecnología de la naturaleza . 32 (5): 462–464. arXiv : 1308.3700 . doi : 10.1038 / nbt.2862 . ISSN 1087-0156 . PMC 4077321 . PMID 24752080 .
- ^ Kanfi, Yariv; Naiman, Shoshana; Amir, Gail; Peshti, Victoria; Zinman, Guy; Nahum, Liat; Bar-Joseph, Ziv; Cohen, Haim Y. (marzo de 2012). "La sirtuina SIRT6 regula la vida útil en ratones machos". Naturaleza . 483 (7388): 218–221. Código Bibliográfico : 2012Natur.483..218K . doi : 10.1038 / nature10815 . PMID 22367546 .
- ^ Naik, Armaghan W .; Kangas, Joshua D .; Sullivan, Devin P .; Murphy, Robert F. (3 de febrero de 2016). "Experimentación activa impulsada por el aprendizaje automático para determinar los efectos compuestos en los patrones de proteínas" . eLife . 5 : e10047. doi : 10.7554 / eLife.10047 . PMC 4798950 . PMID 26840049 .
- ^ "El sistema impulsado por robots de los científicos podría reducir el costo de descubrimiento de interacciones entre fármacos y objetivos | Escuela de Ciencias de la Computación Carnegie Mellon" . www.cs.cmu.edu . Consultado el 15 de marzo de 2016 .
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- ^ Universidad, Carnegie Mellon. "Votación Facultad-Departamento de Biología Computacional - Universidad Carnegie Mellon" . cbd.cmu.edu . Archivado desde el original el 8 de marzo de 2015 . Consultado el 14 de marzo de 2016 .
- ^ "RECOMB 2014 - 2-5 de abril, Pittsburgh, Pennsylvania" . murphylab.web.cmu.edu . Consultado el 14 de marzo de 2016 .
- ^ "CASA" . www.iscb.org . Consultado el 14 de marzo de 2016 .
- ^ Universidad, Carnegie Mellon. "Análisis automatizado del genoma personal para asesores clínicos: desafíos y soluciones-Departamento de Biología Computacional - Universidad Carnegie Mellon" . cbd.cmu.edu . Archivado desde el original el 6 de septiembre de 2015 . Consultado el 29 de marzo de 2016 .
- ^ Universidad, Carnegie Mellon. "Bioimage Informatics 2010-Departamento de biología computacional - Universidad Carnegie Mellon" . cbd.cmu.edu . Archivado desde el original el 30 de marzo de 2015 . Consultado el 14 de marzo de 2016 .
- ^ "Programa conjunto de doctorado CMU-Pitt en biología computacional (CPCB)" . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
- ^ Universidad, Carnegie Mellon. "Maestría en Biología Computacional - Universidad Carnegie Mellon" . www.cmu.edu . Consultado el 14 de marzo de 2016 .
- ^ "Innovación en biotecnología y computación en la Universidad Carnegie Mellon" . bic.cs.cmu.edu . Archivado desde el original el 9 de marzo de 2016 . Consultado el 14 de marzo de 2016 .
- ^ "Licenciatura en Biología Computacional | Departamento de Biología Computacional" . Departamento de Biología Computacional | Universidad Carnegie Mellon . Consultado el 7 de febrero de 2017 .
- ^ Universidad, Carnegie Mellon. "Mención en el Departamento de Biología Computacional-Biología Computacional - Universidad Carnegie Mellon" . cbd.cmu.edu . Consultado el 14 de marzo de 2016 .