SUI1

Estructura de la solución de RMN del gen yciH de E. coli .

Identificadores

Símbolo

SUI1

Pfam

PF01253

InterPro

IPR001950

PROSITE

PDOC00862

SCOP2

2if1 / SCOPe / SUPFAM

Estructuras proteicas disponibles:
Pfam	estructuras / ECOD
PDB	RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsum	resumen de estructura

En biología molecular , la proteína de dominio único SUI1 es un factor de iniciación de la traducción que se encuentra a menudo en el hongo Saccharomyces cerevisiae (levadura de Baker), pero también se encuentra en otros eucariotas y procariotas , así como en arqueas . También se conoce como factor de iniciación de la traducción eucariota 1 ( eIF1 ) en eucariotas o YciH en bacterias. ^[1]

Función

SUI1 es un factor de inicio de la traducción que dirige el ribosoma al sitio de inicio de la traducción , ayudado por eIF2 y el iniciador Met - tRNA _i^Met . ^[2] SUI1 asegura que el inicio de la traducción comience desde el codón de inicio correcto (generalmente AUG), estabilizando el complejo de preiniciación alrededor del codón de inicio. SUI1 promueve una alta fidelidad de iniciación para el codón AUG, discriminando los codones que no son AUG. ^[3]

Sin embargo, en E. coli , parece que el homólogo de SUI1 YciH es un inhibidor de la traducción durante el estrés. ^[4]

Estructura

La estructura primaria de la proteína SUI1 está formada por 108 aminoácidos . El dominio de la proteína tiene una estructura hecha de una hélice beta de siete palas y también contiene una hélice alfa C-terminal . ^[5] Se han encontrado homólogos de SUI1 ^[6] en mamíferos , insectos y plantas . SUI1 también está relacionado evolutivamente con proteínas de Escherichia coli (yciH), Haemophilus influenzae (HI1225) y Methanococcus vannielii . ^[5]

Referencias

^ Procariota + Iniciación + Factor-3 en los encabezados de temas médicos de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.(MeSH)
^ Yoon HJ, Donahue TF (enero de 1992). "El locus supresor de suil en Saccharomyces cerevisiae codifica un factor de traducción que funciona durante el reconocimiento del tRNA (iMet) del codón de inicio" . Biología Molecular y Celular . 12 (1): 248–60. doi : 10.1128 / mcb.12.1.248 . PMC 364089 . PMID 1729602 .
^ Martin-Marcos P, Cheung YN, Hinnebusch AG (diciembre de 2011). "Los elementos funcionales en los factores de iniciación 1, 1A y 2β discriminan contra el contexto pobre de AUG y los codones de inicio no AUG" . Biología Molecular y Celular . 31 (23): 4814–31. doi : 10.1128 / MCB.05819-11 . PMC 3232919 . PMID 21930786 .
^ Osterman, IA; Evfratov, SA; Dzama, MM; Pletnev, PI; Kovalchuk, SI; Butenko, IO; Pobeguts, OV; Golovina, AY; Govorun, VM; Bogdanov, AA; Sergiev, PV; Dontsova, OA (2015). "Un homólogo bacteriano YciH del factor de iniciación de la traducción eucariota eIF1 regula la expresión génica relacionada con el estrés y es poco probable que participe en la fidelidad de la iniciación de la traducción" . Biología del ARN . 12 (9): 966–71. doi : 10.1080 / 15476286.2015.1069464 . PMC 4615754 . PMID 26177339 .
↑ a b Herrmannová A, Daujotyte D, Yang JC, Cuchalová L, Gorrec F, Wagner S, Dányi I, Lukavsky PJ, Valásek LS (marzo de 2012). "El análisis estructural de un subcomplejo eIF3 revela las interacciones conservadas necesarias para un ensamblaje del complejo de preiniciación de la traducción estable y adecuada" . Investigación de ácidos nucleicos . 40 (5): 2294–311. doi : 10.1093 / nar / gkr765 . PMC 3300007 . PMID 22090426 .
^ Campos C, Adams MD (enero de 1994). "Las etiquetas de secuencia expresada identifican un isólogo humano del factor de iniciación de la traducción suil". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 198 (1): 288–91. doi : 10.1006 / bbrc.1994.1040 . PMID 7904817 .

Este artículo incorpora texto del dominio público Pfam e InterPro : IPR001950

[1] Procariota + Iniciación + Factor-3 en los encabezados de temas médicos de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.(MeSH)

[pmid1729602-2] Yoon HJ, Donahue TF (enero de 1992). "El locus supresor de suil en Saccharomyces cerevisiae codifica un factor de traducción que funciona durante el reconocimiento del tRNA (iMet) del codón de inicio" . Biología Molecular y Celular . 12 (1): 248–60. doi : 10.1128 / mcb.12.1.248 . PMC 364089 . PMID 1729602 .

[pmid21930786-3] Martin-Marcos P, Cheung YN, Hinnebusch AG (diciembre de 2011). "Los elementos funcionales en los factores de iniciación 1, 1A y 2β discriminan contra el contexto pobre de AUG y los codones de inicio no AUG" . Biología Molecular y Celular . 31 (23): 4814–31. doi : 10.1128 / MCB.05819-11 . PMC 3232919 . PMID 21930786 .

[4] Osterman, IA; Evfratov, SA; Dzama, MM; Pletnev, PI; Kovalchuk, SI; Butenko, IO; Pobeguts, OV; Golovina, AY; Govorun, VM; Bogdanov, AA; Sergiev, PV; Dontsova, OA (2015). "Un homólogo bacteriano YciH del factor de iniciación de la traducción eucariota eIF1 regula la expresión génica relacionada con el estrés y es poco probable que participe en la fidelidad de la iniciación de la traducción" . Biología del ARN . 12 (9): 966–71. doi : 10.1080 / 15476286.2015.1069464 . PMC 4615754 . PMID 26177339 .

[pmid22090426-5] Herrmannová A, Daujotyte D, Yang JC, Cuchalová L, Gorrec F, Wagner S, Dányi I, Lukavsky PJ, Valásek LS (marzo de 2012). "El análisis estructural de un subcomplejo eIF3 revela las interacciones conservadas necesarias para un ensamblaje del complejo de preiniciación de la traducción estable y adecuada" . Investigación de ácidos nucleicos . 40 (5): 2294–311. doi : 10.1093 / nar / gkr765 . PMC 3300007 . PMID 22090426 .

[pmid7904817-6] Campos C, Adams MD (enero de 1994). "Las etiquetas de secuencia expresada identifican un isólogo humano del factor de iniciación de la traducción suil". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 198 (1): 288–91. doi : 10.1006 / bbrc.1994.1040 . PMID 7904817 .

[1]