Submarine Super 99 (en japonés :潜水 艦 ス ー パ ー 99 , Hepburn : Sensuikan Sūpā Nain Nain ) es unaserie de manga escrita e ilustrada por Leiji Matsumoto . Fue adaptado a un anime que se emitió en AT-X .
En 20XX, el océano de la Tierra es tomado por un misterioso "imperio oceánico". El comandante en jefe militar del imperio, Hell Deathbird, exige que todos los barcos soliciten su permiso para navegar. La única esperanza de la Tierra es el submarino llamado Super 99 , un misterioso submarino diseñado por el Dr. Juzou Oki.
La historia comienza cuando las fuerzas japonesas decidieron investigar la misteriosa amenaza debajo del océano. Goro Oki le da a su hermano menor, Susumu, un rifle, un arma modificada del rifle Tipo 99 de la era de la Segunda Guerra Mundial; Susumu también recibe una llave con una marca "99" de su abuelo Juzou. Goro y Juzou Oki partieron en un submarino de exploración para investigar los ataques en la Fosa japonesa ; poco después, su barco es atacado por un misterioso submarino que se esconde en la Fosa. La nave de reconocimiento de superficie pierde contacto con el submarino de reconocimiento y dos espías asaltan su puente de mando, tomando a la tripulación como rehén. Los espías son dominados cuando el misterioso submarino intenta torpedear la nave de inspección, y Susumu logra destruir el torpedo entrante con su rifle.