Se sabe muy poco sobre sus antecedentes familiares o sus primeros años de vida, excepto que nació en los Países Bajos en 1648 y que su padre se llamaba Francis. La familia Rogerson probablemente llegó recientemente a Irlanda y es posible que fueran exiliados políticos de los problemas políticos de la década de 1640 en el momento de su nacimiento.
Vivió en Londres a fines de la década de 1660. Está registrado como cabeza de familia de Dublín desde 1674, momento en el que ya estaba en el negocio como comerciante. No está claro cómo precisamente ganó su dinero, pero no hay duda de que se convirtió en un hombre muy rico, con reputación de ser "duro" en sus tratos comerciales. La rica y bien relacionada Susan, Lady Belasyse , que le había prestado sumas sustanciales de dinero, descubrió que él simplemente se negaba a devolverlas, y una demanda por el dinero se prolongó hasta su muerte.
Fue elegido alcalde de Dublín en 1693-1694 y representó a Clogher en el Parlamento de Irlanda de 1692 a 1693, luego a la ciudad de Dublín de 1695 a 1703. Fue un firme partidario de la Revolución Gloriosa y hostil a los católicos romanos , incluso protestando. contra el empleo de trabajadores católicos. Construyó su residencia de campo, "The Glen" o "Glasnevin House" en las afueras del pueblo de Glasnevin : los críticos dijeron que su forma de vida sugería más a un noble que a un comerciante. Un muelle en Dublín se llamó Muelle de Sir John Rogersondebido a su asociación con su desarrollo. En 1713 Dublin Corporation le arrendó tierras junto al río Liffey , con la condición de que construyera un muelle allí.
Se casó en primer lugar con Elizabeth Proby (o Probie), hija de Emmanuel Proby y Mary Bland, y nieta de Sir Peter Probie , alcalde de Dublín y su esposa Elizabeth Thoroughgood. Se casó en segundo lugar con Elizabeth Ward, hija de John Ward y Elizabeth Vincent. Por su primera esposa, fue el padre de John Rogerson (1676-1741) , Lord Presidente del Tribunal Supremo del Banco del Rey en Irlanda , y dos hijos menores, Richard, que era abogado del Middle Temple , y William (fallecido en 1721), quien se casó con Alice Molyneux, hija del destacado médico Sir Thomas Molyneux, primer baronety su segunda esposa, Catherine Howard. También tuvieron una hija, Susanna. Su viuda murió en 1726.
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