Stephen Frank Altschul (nacido el 28 de febrero de 1957) es un matemático estadounidense que ha diseñado algoritmos que se utilizan en el campo de la bioinformática (el algoritmo de Karlin-Altschul [2] y sus sucesores [3] ). Altschul es coautor del algoritmo BLAST utilizado para el análisis de secuencias de proteínas y nucleótidos . [4] [5]
Stephen Altschul | |
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Nació | Stephen Frank Altschul 28 de febrero de 1957 |
Ciudadanía | Estados Unidos |
alma mater | Universidad de Harvard (AB, Matemáticas) Instituto de Tecnología de Massachusetts (Ph.D., Matemáticas) |
Conocido por | EXPLOSIÓN |
Esposos) | Caroline Kershaw James (m. 1994) |
Carrera científica | |
Campos | Bioinformática |
Instituciones | NCBI |
Tesis | Aspectos de la comparación de secuencias biológicas (1987) |
Asesor de doctorado | Daniel Kleitman [1] |
Sitio web | www |
Educación
Altschul se graduó summa cum laude [6] de la Universidad de Harvard , donde fue elegido Phi Beta Kappa en matemáticas y tiene un doctorado. en el mismo campo del Instituto de Tecnología de Massachusetts . [7]
Investigar
Su interés de investigación se centra en algoritmos de alineación de secuencias, estadísticas de comparación de secuencias y medición de similitud de secuencias. [4] [5]
Fondo
Es hijo de Stephanie Rosemary (de soltera Wagner) y Arthur Altschul , ex socio de Goldman Sachs . [8] [9] En 1994, se casó con Caroline Kershaw James, la hija de Caroline James-Pritz de Cincinnati y Harry Keithan James de Dayton, Ohio . El reverendo Luther D. Miller Jr. realizó la ceremonia en la Iglesia Episcopal de St. David en Washington. [6]
Su media hermana es la periodista Serena Altschul conocida por su mandato en MTV . Por parte de su padre, es miembro de la familia Lehman .
Tiene dos hijos, James y William Altschul. William Altschul es un ex jugador universitario de Ultimate en la Universidad de Washington en St. Louis. [10]
De las matemáticas a la bioinformática
Durante sus años de licenciatura, Altschul desarrolló un interés por la biología. Como resultado, comenzó a leer libros sobre ADN. Uno de los libros que leyó fue The Double Helix de Watson. [ cita requerida ] Además, también había tomado un curso de Biología Evolutiva. [ cita requerida ] Altschul también había pasado dos veranos trabajando en laboratorios de la Universidad Rockfeller, donde ayudó a escribir códigos de computadora para un proyecto de cristalografía de rayos X. [ cita requerida ]
Debido a su interés, Altschul había considerado intentar postularse para la escuela de posgrado en biología. [ cita requerida ] En su lugar, decidió postularse a programas de matemáticas aplicadas, con la esperanza de encontrar algunas aplicaciones de las matemáticas a la biología en las que trabajar.
Nombramientos / puestos destacados ocupados
Después de graduarse, Stephen Frank Altschul trabajó en la Rama de Investigación en Matemáticas del Instituto Nacional de Diabetes y Enfermedades Digestivas y Renales como una beca postdoctoral del IRTA. Desde 1990 hasta la actualidad, ha trabajado en la Rama de Biología Computacional del NCBI, ocupando el puesto de investigador senior.
Referencias
- ^ Stephen Altschul en el Proyecto de genealogía matemática
- ^ Altschul, S .; Gish, W .; Miller, W .; Myers, E .; Lipman, D. (1990). "Herramienta básica de búsqueda de alineación local". Revista de Biología Molecular . 215 (3): 403–410. doi : 10.1016 / S0022-2836 (05) 80360-2 . PMID 2231712 .
- ^ Altschul, S .; Madden, TL; Schäffer, AA; Zhang, J .; Zhang, Z .; Miller, W .; Lipman, DJ (1997). "Gapped BLAST y PSI-BLAST: una nueva generación de programas de búsqueda de bases de datos de proteínas" . Investigación de ácidos nucleicos . 25 (17): 3389–3402. doi : 10.1093 / nar / 25.17.3389 . PMC 146917 . PMID 9254694 .
- ^ a b Lista de publicaciones de Microsoft Academic
- ^ a b Stephen F. Altschul en el servidor de bibliografía DBLP
- ^ a b New York Times: "Bodas; Caroline James, Stephen Altschul" 17 de abril de 1994
- ^ Altschul, Stephen Frank (1987). Aspectos de la comparación de secuencias biológicas (tesis doctoral). Instituto de Tecnología de Massachusetts.
- ^ Aviso de muerte de Arthur Goodhart Altschul
- ^ https://www.nytimes.com/1956/03/18/archives/trota-announced-of-miss-wagner-to-be-wed-in-may.html
- ^ https://play.usaultimate.org/teams/events/Eventteam/?TeamId=x%2f0V5EX9wIVnzxDyk7NGO5XjowKF%2boMV0pElxx1dgY8%3d
enlaces externos
- highcited.com