El Protocolo Sigma es la última novela escrita íntegramente por Robert Ludlum , y fue publicada póstumamente. Es la historia del hijo de unsobreviviente del Holocausto que se ve envuelto en una conspiración internacional de industriales y financieros para aprovechar la tecnología de tiempos de guerra.
Ben Hartman está de vacaciones en Suiza cuando conoce a su antiguo compañero de escuela Jimmy Cavanaugh, quien intenta matarlo. Mientras esquiva asesinos , colas misteriosas y policías mientras busca un lugar seguro para esconderse, encuentra a su hermano gemelo, Peter, quien se cree que murió en un accidente de avión varios años antes. Peter describe una corporación internacional que se formó en los últimos días de la Segunda Guerra Mundial , compuesta por financieros, miembros influyentes de grandes corporaciones y jefes nazis . Le da a Ben una foto de algunos de los líderes, solo para descubrir que su padre era miembro. Pronto, Peter es asesinado por un asesino y Ben vuelve a escapar con vida. Más tarde se encuentra con Liesel (la novia de Peter).
Mientras tanto, la agente del Departamento de Justicia de los Estados Unidos , Anna Navarro, es reclutada por un grupo secreto dentro del Departamento de Justicia para investigar la muerte de una lista de hombres influyentes de todo el mundo que han estado muriendo misteriosamente. Sus sondas arrojan pistas falsas, posibles encubrimientos y callejones sin salida, hasta que descubre que los hombres han sido envenenados por alguien que usa la misma oscura toxina. Siguiendo las pistas, descubre que los hombres que le habían asignado para investigar son parte de un grupo internacional de financistas y magnates de los negocios. Pronto se entera de que la han informado "fuera de la reserva", y los atentados también comienzan en su vida.
A través de sus propios medios de investigación distintos, los dos protagonistas descubren más sobre el grupo de sombras, que se llama Sigma. Se sabe que Sigma ha pasado de ser un simple intento de saquear el tesoro nazi y estabilizar el estado industrial y financiero del mundo a raíz de la guerra, a una máquina política y financiera que controla hasta el 75% de los líderes mundiales. empresas, y tiene suficiente influencia política encubierta para influir directamente en el resultado de elecciones presidenciales como la del tipo . Sigma también ayudó a algunos de los criminales de guerra nazis, incluido el médico nazi Gerhard Lenz, a evadir la captura.
Los protagonistas Hartman y Navarro finalmente se encuentran y forman una alianza, ya que ambos están siendo perseguidos por los asesinos de Sigma. A través de sus esfuerzos concertados, descubren que Sigma está experimentando una lucha interna. Los fundadores, muertos o moribundos, creen que Sigma debería disolverse, ya que había jugado su papel en el mundo; se llaman los angeli rebeldes y están siendo perseguidos por los nuevos líderes de Sigma. Ese nuevo liderazgo, un médico aparentemente filantrópico llamado Jürgen Lenz, hijo del miembro fundador de Sigma, Gerhard Lenz, ha decidido una nueva dirección para el grupo y está decidido a eliminar cualquier oposición interna.
Navarro es secuestrado por Lenz y Hartman los rastrea hasta un antiguo castillo en los Alpes austríacos . Al infiltrarse con éxito en el castillo, descubre la nueva dirección de Sigma: el cambio de edad. Lenz había encontrado una manera de revertir el envejecimiento humano basado principalmente en la experimentación de la era de la Segunda Guerra Mundial en niños con envejecimiento prematuro también conocido como progeria , y había estado tratando a algunos miembros de la élite mundial para revertir su envejecimiento también. Lenz fue su primer experimento exitoso, ya que su nombre real es Gerhard: es el médico nazi y miembro fundador de Sigma. Después de matar a Lenz, Hartman y Navarro escapan en un helicóptero, mientras que el castillo es destruido por una avalancha.