En 1567 ingresó en la Compañía de Jesús . Al principio se le negó la entrada debido a un impedimento en su habla; sin embargo, luego de implorar la liberación de este impedimento ante una imagen de María en Córdoba, España , su solicitud fue concedida. Durante un tiempo fue maestro de novicios en Granada . El resto de su vida lo dedicó a la composición de sus obras. Murió de neumonía .
Sus contemporáneos dan testimonio de la energía y perseverancia con la que trabajó para la superación personal desde el noviciado hasta su muerte. Su celo penitencial rivalizó con el de los primeros anacoretas y, según su director espiritual, llevó su inocencia bautismal a la tumba. Luis de la Puente , entonces rector del colegio de Granada y luego declarado " venerable ", da fe de la santidad de Sánchez en su carta a Francisco Suárez , cuya traducción se puede encontrar en la Bibliothèque de Bourgogne de Bruselas .
La obra principal de Sánchez (y la única que él mismo editó) es Disputationes de sancto matrimonii sacramento . Se dice que la primera edición apareció en Génova en 1602; pero este puede haber sido solo el primer volumen en folio , para el cual se obtuvo el permiso de impresión en 1599, ya que los dos volúmenes siguientes contienen tanto en su prefacio como en la dedicatoria del autor la fecha de 1603. La primera edición completa fue, según Sommervogel , que de Madrid , 1605; Posteriormente siguió una serie de ediciones impresas en diferentes lugares antes y después de la muerte del autor. La última edición parece haber sido publicada en Venecia en 1754.
Algunas ediciones del tercer volumen se han incluido en el Índice de libros prohibidos , no siendo el fundamento la doctrina del autor, sino la perversión de la obra y la supresión de lo que el autor enseñó. Incluso en las ediciones anteriores del Índice revisado por León XIII , hasta su Constitución " Officorum ac munerum " , todavía podemos leer:
" Sánchez, Thom. Disputationum de Sacramento Matrimonii tom. III. Ed. Venetiae, sive alarium, a quibus 1.8 disp. 7 detractus est integer num. 4. Decr. 4 Febr. 1627 ".
Este número se omite en la edición de Venecia de 1614; trata del poder del Papa para otorgar una legitimación válida a la descendencia de matrimonios inválidos solo a través del derecho canónico a través del llamado sanatio in radice . El modo de expresión del autor muestra una verbosidad no siempre agradable.