TreeBASE

TreeBASE ^[1] es un repositorio de datos filogenéticos publicados en revistas científicas . En los estudios filogenéticos, se recopilan o generan datos de investigación, como observaciones comparativas (por ejemplo , matrices de estado de carácter o alineaciones de secuencias múltiples ) realizadas en un conjunto de taxones , metadatos sobre estos taxones y los árboles filogenéticos que se infieren para describir mejor las relaciones evolutivas. entre los taxones.

Misión

El propósito del proyecto TreeBASE es proporcionar registros e identificadores estables para estos datos, de modo que otros trabajadores puedan hacer referencia a sus datos depositados en su publicación, y otros científicos puedan localizar los datos y usarlos para verificar la investigación original o para incluir o ampliarlos en análisis posteriores.

Historia y financiación

El proyecto se inició en 1994, ^[2]^[3] con financiación de la Fundación Nacional de Ciencias de EE . UU . Después de este prototipo, se inició un rediseño en el marco del proyecto CIPRES ^[4] . Esta nueva versión fue lanzada en marzo de 2010 y ha sido apoyada, entre otros, por el proyecto pPOD, ^[5] que financió la adición de una interfaz de servicio web RESTful con servicios de búsqueda CQL , ^[6] y el Centro Nacional de Síntesis Evolutiva (NESCent) , que aloja la base de datos y el servidor web.

A partir del invierno de 2010, TreeBASE se reorganizó y se asoció con la Phyloinformatics Research Foundation ^[7].

Referencias

^ "TreeBASE" . Consultado el 5 de abril de 2011 .
^ Sanderson, MJ; MJ Donoghue; W. Piel; T. Eriksson (1994). "TreeBASE: una base de datos prototipo de análisis filogenéticos y una herramienta interactiva para explorar la filogenia de la vida". Revista estadounidense de botánica . 81 (6): 183. doi : 10.2307 / 2445447 . JSTOR 2445447 .
^ Piel, WH; MJ Donoghue; MJ Sanderson (2002). "TreeBASE: una base de datos de conocimiento filogenético". Al "Catálogo de la vida" interoperable con los socios Species 2000 Asia Oceanea. Informe de investigación del Instituto Nacional de Estudios Ambientales (171): 41–47.
^ "CyberInfrastructure para la investigación filogenética" . Consultado el 5 de abril de 2011 .
^ "procesamiento de PhylOData" . Consultado el 5 de abril de 2011 .
^ Vos, Rutger A .; Hilmar Lapp; William H. Piel; Val Tannen (2010). "TreeBASE2: Rise of the Machines" . Precedencias de la naturaleza . doi : 10.1038 / npre.2010.4600 .
^ "Fundación de investigación filoinformática" . Consultado el 5 de abril de 2011 .

Este artículo científico es un esbozo . Puedes ayudar a Wikipedia expandiéndolo .

[1] "TreeBASE" . Consultado el 5 de abril de 2011 .

[2] Sanderson, MJ; MJ Donoghue; W. Piel; T. Eriksson (1994). "TreeBASE: una base de datos prototipo de análisis filogenéticos y una herramienta interactiva para explorar la filogenia de la vida". Revista estadounidense de botánica . 81 (6): 183. doi : 10.2307 / 2445447 . JSTOR 2445447 .

[3] Piel, WH; MJ Donoghue; MJ Sanderson (2002). "TreeBASE: una base de datos de conocimiento filogenético". Al "Catálogo de la vida" interoperable con los socios Species 2000 Asia Oceanea. Informe de investigación del Instituto Nacional de Estudios Ambientales (171): 41–47.

[4] "CyberInfrastructure para la investigación filogenética" . Consultado el 5 de abril de 2011 .

[5] "procesamiento de PhylOData" . Consultado el 5 de abril de 2011 .

[6] Vos, Rutger A .; Hilmar Lapp; William H. Piel; Val Tannen (2010). "TreeBASE2: Rise of the Machines" . Precedencias de la naturaleza . doi : 10.1038 / npre.2010.4600 .

[7] "Fundación de investigación filoinformática" . Consultado el 5 de abril de 2011 .

[1]