El priorato fue fundado en el siglo XII, y estaba dedicado a la Santísima Virgen ya Santa María Magdalena . Existe cierta incertidumbre sobre el nombre del fundador: el obituario del calendario del convento afirma que Richard Holte y Christina su esposa, la hija de Thomas Cobreth, fundaron la casa y Geoffrey Fitz Peter fundó la primera iglesia. Pero Leland afirma que los fundadores fueron Roger Cobreth y su hijo Thomas. La familia Cobreth claramente tenía asociaciones cercanas con el priorato ya que varios miembros eran benefactores y una dama, Diana Cobreth, tenía su corazón enterrado ante el altar mayor.
La iglesia o capilla temporal original fue reemplazada en 1234 por una iglesia de piedra, fundada por Richard de Herriard . Varios otros miembros de la familia de Herriard fueron benefactores del convento.
En 1316 las finanzas del priorato estaban en mal estado debido a "negligencia y mala administración" y las monjas se dispersaban ya que no se hacían provisiones para su comida. Esto quizás estuvo relacionado con las hambrunas de 1315 y años posteriores. El arzobispo de Canterbury instituyó una comisión con plenos poderes "para visitar el convento e investigar, corregir, reformar y castigar los excesos de los delincuentes". Esto parece haber cambiado las cosas en la década de 1320. Sin embargo, en 1398 y nuevamente en 1404 se eximió al priorato de la recaudación de la segunda mitad de la décima "por ser una casa de monjas pobres muy gravadas".
La iglesia de St. Mary, Hartley Wintney , fue incluida en la dotación original y la priora y las monjas presentaron a los vicarios hasta la Disolución .
El 23 de mayo de 1536, los comisionados visitaron el priorato de Wintney, "una casa de monjas, orden de Cisteaux". Estimaron su valor anual en £52 5s. 8d. y encontró allí a diez monjas, "por informe de buena conversación, las cuales deseaban continuar en la misma religión". Había también dos sacerdotes, un sirviente que esperaba, trece ciervas, nueve sirvientas y dos " corodiers " con sus dos sirvientes. La iglesia y la mansión estaban en buen estado, excepto por los azulejos, pero la cocina y la sala de cocción estaban muy deterioradas.
Sir William Poulet , contralor de la casa del rey, recibió una concesión del sitio y las tierras de la priora en agosto de 1536. En mayo de 1538, "la casa y el sitio del priorato disuelto de Wintney, con la iglesia, el campanario y el cementerio de lo mismo, la casa solariega y la rectoría de Hartley Wintney y todas las tierras pertenecientes" fueron otorgadas a Richard Hill y Elizabeth su esposa. Una carta de 1538 de Richard Poulet al Sr. Hill le ordenaba "en nombre de los comisionados del rey, dejar de desfigurar cualquiera de los edificios del difunto priorato de Wintney además de los que el rey le había dado, que eran solo el claustro. y el dorter".