ARN ribosómico 5.8S

ARN ribosómico 5.8S
Estructura secundaria prevista y conservación de la secuencia del ARN ribosómico 5.8S
Identificadores
Símbolo	5_8S_rRNA
Rfam	RF00002
Otros datos
Tipo de ARN	Gene ; ARNr
Dominio (s)	Eucariota ; Archaea ^{[ cita requerida ]}
VAMOS	IR: 0003735 IR: 0005840
ASI QUE	Entonces: 0000375
Estructuras PDB	PDBe

En biología molecular, el ARN ribosómico 5.8S ( ARNr 5.8S ) es un componente de ARN no codificante de la subunidad grande del ribosoma eucariota y, por lo tanto, juega un papel importante en la traducción de proteínas . Es transcrito por la ARN polimerasa I como parte del precursor 45S que también contiene ARNr 18S y 28S . Se cree que su función es la translocación de los ribosomas. ^[1] También se sabe que forma un enlace covalente con la proteína supresora de tumores p53 . ^{[2] El} ARNr 5.8S se puede utilizar como gen de referencia para el miARN.detección. ^[3] El ARN ribosómico 5.8S se utiliza para comprender mejor otros procesos y vías de ARNr en la célula. ^[4]

El ARNr 5.8S es homólogo al extremo 5 'del ARNr de LSU no eucariota . En eucariotas, la inserción de ITS2 rompe el ARNr de LSU en ARNr 5.8S y 28S . ^[5] Algunas moscas tienen su ARNr 5.8 más dividido en dos partes. ^[6]

Estructura

La estructura del ARNr de L567.5 tiene un tamaño de aproximadamente 150 nucleótidos y consta de muchas hebras plegadas, algunas de las cuales se presume que son monocatenarias. ^[7] Este ARN ribosómico, junto con el ARNr 28S y 5S, así como 46 proteínas ribosómicas , forman la subunidad grande ribosómica (LSU) . ^[7] El ARNr 5.8S se transcribe inicialmente junto con el ARNr 18S y 28S en el ARN preribosómico 45S, junto con ITS 1 e ITS 2 ( espaciador transcrito interno ) y un ETS 5 'y 3' ( espaciador transcrito externo ). ^[8]El ARNr 5.8S está ubicado entre las dos regiones ITS, con ITS1 separándolo del ARNr 18S en la dirección 5 'e ITS2 separándolo del ARNr 28S en la dirección 3'. ITS y ETS se escinden durante la maduración del ARNr. Esto se logra a través de una ruta de escisión continua realizada por enzimas endonucleasa y exonucleasa , cortando los espaciadores en ubicaciones específicas. ^[8]

Referencias

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^ Fontoura BM, Atienza CA, Sorokina EA, Morimoto T, Carroll RB (junio de 1997). "El polipéptido p53 citoplasmático está asociado con los ribosomas" . Biología Molecular y Celular . 17 (6): 3146–3154. doi : 10.1128 / MCB.17.6.3146 . PMC 232167 . PMID 9154813 .
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^ Shimada, T. (agosto de 1992). "Distribución de ARN ribosómico dividido 5.8S en Diptera". Biología Molecular de Insectos . 1 (1): 45–48. doi : 10.1111 / j.1365-2583.1993.tb00076.x . PMID 1343775 .
↑ a b Walker TA, Pace NR (junio de 1983). "ARN ribosómico 5.8S" . Celular . 33 (2): 320–322. doi : 10.1016 / 0092-8674 (83) 90413-0 . PMID 6861202 .
↑ a b Henras AK, Plisson-Chastang C, O'Donohue MF, Chakraborty A, Gleizes PE (27 de octubre de 2014). "Una descripción general del procesamiento de ARN prerribosómico en eucariotas" . Revisiones interdisciplinarias de Wiley: ARN . 6 (2): 225–242. doi : 10.1002 / wrna.1269 . PMC 4361047 . PMID 25346433 .

enlaces externos

Página para ARN ribosómico 5.8S en Rfam
Secuencia de ARNr de Arabidopsis 5.8S
Secuencia de ARNr de Rice 5.8S

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[Abou_1997-1] Abou Elela S, Nazar RN (mayo de 1997). "Papel del ARNr 5.8S en la translocación del ribosoma" . Investigación de ácidos nucleicos . 25 (9): 1788-1794. doi : 10.1093 / nar / 25.9.1788 . PMC 146658 . PMID 9108162 .

[Fontoura_197-2] Fontoura BM, Atienza CA, Sorokina EA, Morimoto T, Carroll RB (junio de 1997). "El polipéptido p53 citoplasmático está asociado con los ribosomas" . Biología Molecular y Celular . 17 (6): 3146–3154. doi : 10.1128 / MCB.17.6.3146 . PMC 232167 . PMID 9154813 .

[s58_real-3] Shi R, Chiang VL (octubre de 2005). "Medios fáciles para cuantificar la expresión de microARN mediante PCR en tiempo real" . BioTechniques . 39 (4): 519-525. doi : 10.2144 / 000112010 . PMID 16235564 .

[Canadian_Ribosome_Ref-4] Nazar RN (junio de 1984). "El ARN ribosómico 5.8S: ¿adaptación eucariota o variante de procesamiento?". Revista canadiense de bioquímica y biología celular . 62 (6): 311–320. doi : 10.1139 / o84-044 . PMID 6380683 .

[5] Lafontaine, DLJ; Tollervey, D. (2001). "La función y síntesis de los ribosomas". Nature Reviews Biología celular molecular . 2 (7): 514–520. doi : 10.1038 / 35080045 . hdl : 1842/729 . PMID 11433365 .

[6] Shimada, T. (agosto de 1992). "Distribución de ARN ribosómico dividido 5.8S en Diptera". Biología Molecular de Insectos . 1 (1): 45–48. doi : 10.1111 / j.1365-2583.1993.tb00076.x . PMID 1343775 .

[Ribosomal_RNA-7] Walker TA, Pace NR (junio de 1983). "ARN ribosómico 5.8S" . Celular . 33 (2): 320–322. doi : 10.1016 / 0092-8674 (83) 90413-0 . PMID 6861202 .

[Overview-8] Henras AK, Plisson-Chastang C, O'Donohue MF, Chakraborty A, Gleizes PE (27 de octubre de 2014). "Una descripción general del procesamiento de ARN prerribosómico en eucariotas" . Revisiones interdisciplinarias de Wiley: ARN . 6 (2): 225–242. doi : 10.1002 / wrna.1269 . PMC 4361047 . PMID 25346433 .

[1]