En enzimología, una aminodesoxicorismato sintasa ( EC 2.6.1.85 ) es una enzima que cataliza la reacción química.
4-amino-4-desoxicorismato sintasa | ||||||||
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![]() Aminodesoxicorismato sintasa | ||||||||
Identificadores | ||||||||
CE no. | 2.6.1.85 | |||||||
No CAS. | 132264-37-0 | |||||||
Bases de datos | ||||||||
IntEnz | Vista IntEnz | |||||||
BRENDA | Entrada BRENDA | |||||||
FÁCIL | NiceZyme vista | |||||||
KEGG | Entrada KEGG | |||||||
MetaCyc | camino metabólico | |||||||
PRIAM | perfil | |||||||
Estructuras PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | |||||||
Ontología de genes | AmiGO / QuickGO | |||||||
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- corismato + L-glutamina4-amino-4-desoxicorismato + L-glutamato
Así, los dos sustratos de esta enzima son corismato y L-glutamina , mientras que sus dos productos son 4-amino-4-desoxicorismato y L-glutamato . [1] [2] [3] [4]
Es parte de una vía para la biosíntesis del ácido para -aminobenzoico (PABA) ; un precursor para la producción de folatos. Los folatos son una familia de cofactores esenciales para los organismos vivos. Los cofactores de folato se utilizan en varias reacciones de transferencia de un carbono necesarias durante la síntesis de metabolitos esenciales, como la metionina y el timidilato . [1]
La aminodesoxicorismato sintasa ( PabB ), una proteína de 51 kDa en E. coli , está codificada por el gen pabB . [2] El 4-amino-4-desoxicorismato, el producto de PabB, puede convertirse en ácido para- aminobenzoico mediante la enzima 4-amino-4-desoxicorismato liasa (PabC) .
No menclatura
Esta enzima pertenece a la clase de transferasas. Esto significa que la aminodesoxicorismato sintasa cataliza la transferencia de un grupo funcional de una molécula a otra. Específicamente, la aminodesoxicorismato sintasa es una transaminasa que transfiere un grupo amino a un cetoácido. El nombre sistemático es Corismato: L-glutamina aminotransferasa. Anteriormente, la aminodesoxicorismato sintasa se denominaba PABA sintasa ; sin embargo, este nombre ya no se recomienda [5] ya que se entiende que la formación de PABA requiere la acción de una enzima adicional ( 4-amino-4-desoxicorismato liasa ).
Los nombres comunes por los que pasa la enzima son: [6]
- Aminodesoxicorismato sintasa
- ADC sintasa
- 4-amino-4-desoxicorismato sintasa
- PabB
Reacción
![Aminodeoxychorismate synthase.png](http://wikiimg.tojsiabtv.com/wikipedia/commons/thumb/1/14/Aminodeoxychorismate_synthase.png/296px-Aminodeoxychorismate_synthase.png)
En ciertas especies microbianas como Escherichia coli, la aminodesoxicorismato sintasa es un complejo heterodimérico compuesto por dos proteínas, glutamina amidotransferasa (PabA) y 4-amino-4-desoxicorismato sintasa (PabB). En otras especies, como plantas o eucariotas inferiores, una enzima que comprende un único polipéptido realiza ambas reacciones.
En Escherichia coli , la reacción es un proceso de dos pasos. La glutamina amidotransferasa (PabA) y la 4-amino-4-desoxicorismato sintasa (PabB) forman un complejo heterodimérico que cataliza la síntesis de 4-amino-4-desoxicorismato. El primer paso ocurre con PabA que extrae el amoníaco de la glutamina. El segundo paso ocurre cuando PabB reacciona ambos sustratos (corismato y amoniaco) para sintetizar 4-amino-4-desoxicorismato.
En plantas como Arabidopsis thaliana , la aminodesoxicorismato sintasa es una enzima monomérica que lleva a cabo ambos pasos de la reacción. [1]
Estructura
La aminodesoxicorismato sintasa (PabB) es una enzima heterodimérica o monomérica, dependiendo del organismo del que proceda. La enzima tiene 452 residuos y consta de pliegues alfa y beta que es muy similar a algunos tipos de antranilato sintasa. El núcleo de PabB consta de dos dominios que forman un sándwich beta. Además, tiene hélices y bucles alrededor del exterior de su núcleo. [3] El sitio de unión del corismato en PabB consta de residuos de aminoácidos que forman el núcleo de la hoja beta y las dos hélices alfa clave. [4]
Ciertas enzimas aminodesoxicorismato sintasa contienen un sitio de unión adicional para el triptófano , que se cree que es un sitio de unión vestigial no funcional. Se cree que la aminodesoxicorismato sintasa puede haber evolucionado a partir de la antranilato sintasa (TrpE) , una enzima que cataliza la producción de un intermedio en el camino hacia el triptófano. [3]
Homólogos
Las enzimas con estructuras similares a la aminodesoxicorismato sintasa son:
- Antranilato sintasa (TrpE)
- Isocorismato sintasa (MenF)
- Sintasa de salicilato
Una característica común entre esta lista de enzimas es que todas utilizan corismato como sustrato.
Objetivo de la droga anti-folato
La aminodesoxicorismato sintasa está dirigida por los antibióticos atrop- abyssomicina C y ácido 6-fluoroshikímico . Al inhibir la producción de un intermedio en la vía a PABA , se reducen los niveles de folato. Sin suficiente folato, la síntesis de ADN y proteínas se ve gravemente afectada.
Referencias
- ↑ a b c SAHR, Tobias (15 de mayo de 2006). "Síntesis de folato en plantas: purificación, propiedades cinéticas e inhibición de la aminodesoxicorismato sintasa" . Biochem. J . 396 (1): 157–62. doi : 10.1042 / BJ20051851 . PMC 1449997 . PMID 16466344 .
- ^ a b Ye, Qi-Zhuang (23 de agosto de 1990). "Síntesis de p-aminobenzoato en Escherichia coli: Purificación y caracterización de PabB como aminodesoxicorosmato sintasa y enzima X como aminodesoxicorismato liasa" . Proc Natl Acad Sci USA . 87 (23): 9391–5. Código Bibliográfico : 1990PNAS ... 87.9391Y . doi : 10.1073 / pnas.87.23.9391 . PMC 55171 . PMID 2251281 .
- ^ a b c Parsons, James (21 de noviembre de 2001). "Estructura de la sintasa de aminodesoxicorismato de Escherichia coli: conservación arquitectónica y diversidad en enzimas que utilizan corismato". Bioquímica . 41 (7): 2198–2208. doi : 10.1021 / bi015791b . PMID 11841211 .
- ^ a b Bera, Asim (21 de diciembre de 2013). "Estructura de la sintasa de aminodesoxicorismato de Stenotrophomonas maltophilia" . Bioquímica . 51 (51): 10208-17. doi : 10.1021 / bi301243v . PMC 3532939 . PMID 23230967 .
- ^ Green JM, Nichols BP (1991). "Biosíntesis de p-aminobenzoato en Escherichia coli. Purificación de aminodesoxicorismato liasa y clonación de pabC" . J. Biol. Chem . 266 (20): 12971–5. PMID 2071583 .
- ^ "ENZIMA: 2.6.1.85" . KEGG.
- Ye QZ, Liu J, Walsh CT (1990). "Síntesis de p-aminobenzoato en Escherichia coli: purificación y caracterización de PabB como aminodesoxicorismato sintasa y enzima X como aminodesoxicorismato liasa" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 87 (23): 9391–5. Código Bibliográfico : 1990PNAS ... 87.9391Y . doi : 10.1073 / pnas.87.23.9391 . PMC 55171 . PMID 2251281 .
- Viswanathan VK, Green JM, Nichols BP (1995). "Caracterización cinética de 4-amino 4-desoxicorismato sintasa de Escherichia coli" . J. Bacteriol . 177 (20): 5918–23. PMC 177419 . PMID 7592344 .